RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 Q9H8V8 135 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.46□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 A0A087WWL8 130 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 RHODO00212 210 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 PAX4O43316 350 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 SSTP61278 116 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 CBLN2Q8IUK8 224 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.45□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 HIGD1CA8MV81 97 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 NTF3P20783 257 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 PGLYRP4Q96LB8 373 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.44□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 PPP1R2P9O14990 202 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 Q6ZSN1 163 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 SLC25A29Q8N8R3 303 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 AP1S3Q96PC3 154 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.43□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 A0A096LPF7 62 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 CCL18P55774 89 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 TWIST1Q15672 202 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.42□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 NUP35Q8NFH5 326 aa9.42□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 MT-ND4LP03901 98 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 TRGC1P0CF51 173 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 LINC00315P59091 139 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 RHOHQ15669 191 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 ANAPC16Q96DE5 110 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 NAT8BQ9UHF3 227 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 ICOSQ9Y6W8 199 aa9.41□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GUT8 65 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 COLCA2A8K830 154 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 K7EQD1 137 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 SMIM17P0DL12 118 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 GYPEP15421 78 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 EVI2AP22794 236 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 RAB4BP61018 213 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 BORCS7Q96B45 105 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 YPEL4Q96NS1 127 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.4□□□□□ -0.9
CS-231ENST00000552222 RIGQ13278 110 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 ZNF56Q15929 161 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 ESRGQ1W209 222 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 DPH3P1Q9H4G8 78 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 Q9UF83 564 aa9.38□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 F5H697 171 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 SRIP30626 198 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.37□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 FAM229AH3BQW9 127 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 MGPP08493 103 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 LINC00694P0DN24 101 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 NEGR1Q7Z3B1 354 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 SH2D6Q7Z4S9 175 aa9.36□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 GAGE12JA6NER3 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 M0QY20 66 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 GAGE1Q13065 139 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 GAGE4Q13068 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 GAGE5Q13069 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 ELOBQ15370 118 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 GAGE13Q4V321 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 IMMP2LQ96T52 175 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GW15 77 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GXF2 115 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.34□□□□□ -0.91
CS-231ENST00000552222 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 RAB5AP20339 215 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 S100PP25815 95 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 TIRAPP58753 221 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 TTC32Q5I0X7 151 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 RNF213Q63HN8 5207 aa9.33□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 H7C1H1 209 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 CAMPP49913 170 aa9.32□□□□□ -0.92
CS-231ENST00000552222 HBBP68871 147 aa9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161.8 ms