RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 C17orf58Q2M2W7 97 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-13P0DP09 117 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 C14orf177Q52M58 125 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LYZL1Q6UWQ5 148 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.84□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 USF3Q68DE3 2245 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 A6NDX4 124 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SCXQ7RTU7 201 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf74Q96GX8 76 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf142B7Z368 130 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 J3QL48 77 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf48Q96LS8 159 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 H0YGX0 51 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CGB3P0DN86 165 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CYYR1Q96J86 154 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SNURFQ9Y675 71 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C19orf84I3L1E1 186 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CFHR3Q02985 330 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZVQ6 151 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM223A0PJW6 202 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-48P01763 117 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 GPHB5Q86YW7 130 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 FREM3P0C091 2139 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 BCE1O60756 84 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB130BP0DP73 79 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB130AP0DP74 79 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 LMO4P61968 165 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN13Q12923 2485 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ARMS2P0C7Q2 107 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 GYPEP15421 78 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SPRNQ5BIV9 151 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CTSZQ9UBR2 303 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 DOCK9Q9BZ29 2069 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFB1O75438 58 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGLV3-1P01715 115 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CGB7P0DN87 165 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C11orf71Q6IPW1 123 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TFF1P04155 84 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZSR3 168 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 K7ERS5 55 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 G3V318 75 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C8orf49Q96NF6 230 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PSPHP1O15172 72 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PDE6GP18545 87 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 LIMD2Q9BT23 127 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PRR15LQ9BU68 103 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0A6YYD4 124 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF134P52741 427 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2D3P61077 147 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 UBE2D2P62837 147 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ODF3Q96PU9 254 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 MPDZO75970 2070 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 SH2D1AO60880 128 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PRM2P04554 102 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CD28P10747 220 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 NRACQ8N912 160 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 CCKP06307 115 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ENHOQ6UWT2 76 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 PMS2P5A8MQ11 134 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 Q86TA4 180 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 ALPK3Q96L96 1907 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00473A8K010 186 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N6K4 173 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-210ENST00000551525 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms