RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 TEX261Q6UWH6 196 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 OCC1Q8TAD7 63 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 ZFP82Q8N141 532 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 SFRP2Q96HF1 295 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 UPK3BQ9BT76 320 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 Q9UF83 564 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-217ENST00000550044 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 GAGE12JA6NER3 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 EPM2AB3EWF7 344 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 TMEM250H0YL14 139 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 K7EN84 100 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 NXPH4O95158 308 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 P01737 135 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 CRYGDP07320 174 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 GAGE1Q13065 139 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 GAGE4Q13068 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 GAGE5Q13069 117 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 RHOHQ15669 191 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SMIM12Q96EX1 92 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 FAM210AQ96ND0 272 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 TPPP3Q9BW30 176 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SIVA1O15304 175 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SNAI2O43623 268 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 CXCL1P09341 107 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 OR5AL1P0C617 328 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 VPREB1P12018 145 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 BIN3Q9NQY0 253 aa6.57□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 RHODO00212 210 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 NPSP0C0P6 89 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 FAT1Q14517 4588 aa6.56□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 A0A0A0MQY5 61 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 XKRY2A2RUG3 117 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 ZNF727A8MUV8 499 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 C9JQL5 133 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 IGLC6P0CF74 106 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SH2D6Q7Z4S9 175 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 C6orf223Q8N319 242 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 ERVFC1-1P60608 527 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 ZNF56Q15929 161 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 TTC32Q5I0X7 151 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.54□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 F2Z2F3 143 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 SMIM17P0DL12 118 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 NTF3P20783 257 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 RAB4BP61018 213 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 PEA15Q15121 130 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.53□□□□□ -1.36
CS-217ENST00000550044 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 A0A1W2PPQ1 181 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 MGPP08493 103 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 EVI2AP22794 236 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 CACNG7P62955 275 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 LELP1Q5T871 98 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 LINC01551Q86U37 167 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 GTSF1Q8WW33 167 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 AP1S3Q96PC3 154 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.52□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 IGHV3-30P01768 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 IGHV3-33P01772 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 LINC00694P0DN24 101 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 LINC00315P59091 139 aa6.51□□□□□ -1.37
CS-217ENST00000550044 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
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