RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 STOML3Q8TAV4 291 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 TCEAL7Q9BRU2 100 aa10.91□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 GIPP09681 153 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 SSTP61278 116 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 RBX1P62877 108 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 SDIM1Q6ZPB5 146 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 DERL1Q9BUN8 251 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 PRR34Q9NV39 138 aa10.9□□□□□ -0.66
CS-214ENST00000548849 A0A0D9SG52 128 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 FHITP49789 147 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.89□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 CXCL1P09341 107 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 DPH3Q96FX2 82 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 VAX2Q9UIW0 290 aa10.88□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 SNAI2O43623 268 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 PAGE4O60829 102 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 SMIM17P0DL12 118 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 MT1HL1P0DM35 61 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 Q6ZRU5 148 aa10.87□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.86□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 hDV102S1A0JD36 115 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 S100A9P06702 114 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 OR5AL1P0C617 328 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 REG3AQ06141 175 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 BAGE2Q86Y30 109 aa10.85□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 MLST8Q9BVC4 326 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.84□□□□□ -0.67
CS-214ENST00000548849 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 SCO2A0A1W2PP80 73 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 IQCJQ1A5X6 159 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 AP1S3Q96PC3 154 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 CYTL1Q9NRR1 136 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.83□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GV50 99 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 RAB5CP51148 216 aa10.82□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 A0A087WYN8 130 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 ARPC5O15511 151 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 PFDN1O60925 122 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 P01737 135 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 MGPP08493 103 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.81□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 CHTF8P0CG12 524 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 TPPP3Q9BW30 176 aa10.8□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 H7C1H1 209 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 M0QY20 66 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 SLPIP03973 132 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 TMUB2Q71RG4 321 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 RNF185Q96GF1 192 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.79□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 G3V3Q6 166 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 SPACA4Q8TDM5 124 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 TMEM243Q9BU79 118 aa10.78□□□□□ -0.68
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GUV1 79 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 GZMBP10144 247 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 KCNRGQ8N5I3 272 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 GFRA4Q9GZZ7 299 aa10.77□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 LRP2P98164 4655 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 PHOX2AO14813 284 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 WDR73Q6P4I2 378 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 C7orf33Q8WU49 177 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 TNXBP22105 4242 aa10.76□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 UBE2L6O14933 153 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 RASL11AQ6T310 242 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.75□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 UMAD1C9J7I0 102 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 IGLC6P0CF74 106 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 SULT1A2P50226 295 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 CACNG7P62955 275 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.74□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 COX6A2Q02221 97 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 CFAP161Q6P656 301 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 GTSF1Q8WW33 167 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 NIT2Q9NQR4 276 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 RNF213Q63HN8 5207 aa10.73□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 GAGE12HA6NDE8 117 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 SMLR1H3BR10 107 aa10.72□□□□□ -0.69
CS-214ENST00000548849 AMTP48728 403 aa10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms