RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546471.5

RRN3P1-202, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RRN3P1, Length 2,608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-202ENST00000546471 MT-ATP8P03928 68 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 MSMBP08118 114 aa6.97□□□□□ -1.29
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RRN3P1-202ENST00000546471 FAM231AP0DMU4 169 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 FAM231CP0DMU5 169 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 PSMB8P28062 276 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 LY6DQ14210 128 aa6.97□□□□□ -1.29
RRN3P1-202ENST00000546471 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.97□□□□□ -1.29
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RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF580Q9UK33 172 aa6.97□□□□□ -1.29
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RRN3P1-202ENST00000546471 SLC25A20O43772 301 aa6.97□□□□□ -1.29
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RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.94□□□□□ -1.3
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RRN3P1-202ENST00000546471 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.91□□□□□ -1.3
RRN3P1-202ENST00000546471 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.91□□□□□ -1.3
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RRN3P1-202ENST00000546471 LITAFQ99732 161 aa6.91□□□□□ -1.3
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RRN3P1-202ENST00000546471 TRIAP1O43715 76 aa6.91□□□□□ -1.3
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RRN3P1-202ENST00000546471 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
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RRN3P1-202ENST00000546471 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.91□□□□□ -1.3
RRN3P1-202ENST00000546471 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3P1-202ENST00000546471 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.9□□□□□ -1.3
RRN3P1-202ENST00000546471 ELANEP08246 267 aa6.9□□□□□ -1.3
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RRN3P1-202ENST00000546471 FAM104AQ969W3 186 aa6.9□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.9□□□□□ -1.31
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RRN3P1-202ENST00000546471 PROK1P58294 105 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 LINC01600Q96MT4 127 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 DUX3Q96PT4 197 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 SNCGO76070 127 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.89□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 ZNF415Q09FC8 603 aa6.88□□□□□ -1.31
RRN3P1-202ENST00000546471 Q5PR19 223 aa6.88□□□□□ -1.31
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