RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545170.5

ATXN3-216, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ATXN3, Length 6,950 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-216ENST00000545170 NCKAP5O14513 1909 aa6.58□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 NLRC5Q86WI3 1866 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 Q8N9L7 120 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 K7EIM0 57 aa6.58□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 ZNF524Q96C55 264 aa6.56□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.55□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.55□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 VWCEQ96DN2 955 aa6.55□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 IGLV2-14P01704 120 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 DCANP1Q8TF63 244 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 DEFB1P60022 68 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 ESM1Q9NQ30 184 aa6.54□□□□□ -1.36
ATXN3-216ENST00000545170 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.54□□□□□ -1.36
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ATXN3-216ENST00000545170 ZNF318Q5VUA4 2279 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 KLK12Q9UKR0 248 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 SIP14410 1827 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.51□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 E7EUB6 86 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-216ENST00000545170 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-216ENST00000545170 CRYGAP11844 174 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-216ENST00000545170 SPRNQ5BIV9 151 aa6.5□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.5□□□□□ -1.37
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ATXN3-216ENST00000545170 LINC00208Q96KT6 92 aa6.49□□□□□ -1.37
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ATXN3-216ENST00000545170 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 TPRP12270 2363 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 PLXNA2O75051 1894 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 CRYGDP07320 174 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 NRACQ8N912 160 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 ESRGQ1W209 222 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 Q6ZQY7 126 aa6.49□□□□□ -1.37
ATXN3-216ENST00000545170 Q8N9W7 124 aa6.49□□□□□ -1.37
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