RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF492Q9P255 531 aa4.17□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.17□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.17□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A087WWC5 75 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A0J9YX75 114 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRAC2D3DTV9 90 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CCDC179H3BU77 68 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TAX1BP3O14907 124 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RASL11AQ6T310 242 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C1orf158Q8N1D5 194 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM18Q96B42 140 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRADC1Q9BSG0 188 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.16□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IZUMO1RA6ND01 250 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MWL6 223 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGKV3-20P01619 116 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV2-11P01706 119 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINK8P0C7L1 97 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLL1P15814 213 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ODF3Q96PU9 254 aa4.15□□□□□ -1.74
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV21A0A0B4J279 112 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KNCNA6PVL3 124 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 F6UB75 175 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV2-8P01709 118 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRGC1P0CF51 173 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLA-DRB4P13762 266 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q8TAT8 98 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BORCS7Q96B45 105 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IMMP2LQ96T52 175 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q9UF83 564 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa4.15□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.14□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C7orf71A4D174 169 aa4.14□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RHODO00212 210 aa4.14□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM236CP0DP71 79 aa4.14□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZVH6 145 aa4.14□□□□□ -1.75
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KCNS1Q96KK3 526 aa4.14□□□□□ -1.75
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CRISP2P16562 243 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DEFB1P60022 68 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ODF3L2Q3SX64 289 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q5XG85 94 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIR2DL4Q99706 377 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q9H8V8 135 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.13□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C19orf71A6NCJ1 209 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 INSP01308 110 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CD7P09564 240 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLC6P0CF74 106 aa4.12□□□□□ -1.75
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CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6AWC8 147 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6Q795 121 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TSKUQ8WUA8 353 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC01587Q99440 93 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MDFICQ9P1T7 246 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 V9GYV3 84 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLLNB2CW77 178 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 K7EP34 96 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APOC4P55056 127 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FXYD7P58549 80 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TMEM256Q8N2U0 113 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ANK2Q01484 3957 aa4.12□□□□□ -1.75
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NOTCH3Q9UM47 2321 aa4.11□□□□□ -1.75
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