RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534499.1

RAB30-AS1-208, Transcript of RAB30 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RAB30-AS1, Length 597 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30-AS1-208ENST00000534499 S100PP25815 95 aa6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 DEFB1P60022 68 aa6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 OR11H2Q8NH07 326 aa6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 V9GYV3 84 aa6.66□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 COLCA2A8K830 154 aa6.65□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CRIP1P50238 77 aa6.65□□□□□ -1.34
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.65□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.65□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 YPEL4Q96NS1 127 aa6.65□□□□□ -1.34
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IMMP2LQ96T52 175 aa6.65□□□□□ -1.34
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.64□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa6.63□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 FABP5P3A8MUU1 101 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SH2D1AO60880 128 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CXCL1P09341 107 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.63□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 Q8NAQ8 132 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.62□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.62□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TMEM189A5PLL7 270 aa6.62□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 A8MWL6 223 aa6.62□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IGLL5B9A064 214 aa6.62□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.62□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.61□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TSPAN13O95857 204 aa6.61□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IGKV3-20P01619 116 aa6.61□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GPX1P07203 203 aa6.61□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CRISP2P16562 243 aa6.61□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.6□□□□□ -1.35
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RAB30-AS1-208ENST00000534499 HIGD1CA8MV81 97 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 KLLNB2CW77 178 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 SPINK4O60575 86 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GZMBP10144 247 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 PRR4Q16378 134 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 Q6AWC8 147 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 AMTNQ6UX39 209 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 NUP35Q8NFH5 326 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 GTSF1Q8WW33 167 aa6.59□□□□□ -1.35
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.58□□□□□ -1.36
RAB30-AS1-208ENST00000534499 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.58□□□□□ -1.36
RAB30-AS1-208ENST00000534499 TYMSP04818 313 aa6.58□□□□□ -1.36
RAB30-AS1-208ENST00000534499 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RAB30-AS1-208ENST00000534499 CXCL6P80162 114 aa6.58□□□□□ -1.36
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