RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533039.2

SOX9-AS1-210, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene SOX9-AS1, Length 426 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.8□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HSPG2P98160 4391 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IFNA1P01562 189 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CRPP02741 224 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SSTP61278 116 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PKIAP61925 76 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HAMPP81172 84 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 WFDC2Q14508 124 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C11orf52Q96A22 123 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 AP1S3Q96PC3 154 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RYR1P21817 5038 aa5.79□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 XKRY2A2RUG3 117 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PDE6DO43924 150 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CCL20P78556 96 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CENPWQ5EE01 88 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SMIM12Q96EX1 92 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DERL1Q9BUN8 251 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TPPP3Q9BW30 176 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BIN3Q9NQY0 253 aa5.78□□□□□ -1.48
SOX9-AS1-210ENST00000533039 H7C1H1 209 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GNG4P50150 75 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SULT1A2P50226 295 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C14orf177Q52M58 125 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.77□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 F2Z2F3 143 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 P01737 135 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MGPP08493 103 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CACNG7P62955 275 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MPV17L2Q567V2 206 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DNAJC30Q96LL9 226 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MED9Q9NWA0 146 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 VAX2Q9UIW0 290 aa5.76□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RAB19A4D1S5 217 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGLV2-8P01709 118 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 HLA-DQA1P01909 254 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRGC1P0CF51 173 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGLC6P0CF74 106 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GZMBP10144 247 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 MIAQ16674 131 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ENHOQ6UWT2 76 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 Q6ZSA8 131 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SLC51BQ86UW2 128 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.75□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 BCL2P10415 239 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC01620Q4KN68 170 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.74□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 M0QY20 66 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NTF3P20783 257 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RBX1P62877 108 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 GAGE6Q13070 117 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 IQCJQ1A5X6 159 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 RASL11AQ6T310 242 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 WDR73Q6P4I2 378 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 SCXQ7RTU7 201 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 C9orf62Q8N4C0 152 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 TMEM243Q9BU79 118 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 NIT2Q9NQR4 276 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 PRR34Q9NV39 138 aa5.72□□□□□ -1.49
SOX9-AS1-210ENST00000533039 USP17L23D6RBM5 183 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-210ENST00000533039 UBE2L6O14933 153 aa5.71□□□□□ -1.5
SOX9-AS1-210ENST00000533039 CTRLP40313 264 aa5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 234.2 ms