RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 TNP2Q05952 138 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 ADIRFQ15847 76 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 TSKUQ8WUA8 353 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 ISOC2Q96AB3 205 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.89□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.88□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 FAM231BA6NCW3 169 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV3-30P01768 117 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV3-33P01772 117 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.87□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 M0QY20 66 aa14.86□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 CLLU1Q5K131 121 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 V9GYV3 84 aa14.85□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 HIGD1CA8MV81 97 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 RASL11AQ6T310 242 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPRK-222ENST00000532751 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GUT8 65 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 NIT2Q9NQR4 276 aa14.81□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 LAGE3Q14657 143 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 NIT1Q86X76 327 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.8□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 A0A087WX48 190 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 PKD1P98161 4303 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 IFITM2Q01629 132 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 FRZBQ92765 325 aa14.79□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 EREGO14944 169 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 PKIAP61925 76 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 RIGQ13278 110 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 Q8N3U1 123 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 NUP35Q8NFH5 326 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 Q9HAA7 133 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM262E9PQX1 116 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 GATD1Q8NB37 220 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 PSCAO43653 123 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 ELOBQ15370 118 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.75□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.74□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 TM2D2Q9BX73 214 aa14.73□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R2P9O14990 202 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 IQCJQ1A5X6 159 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 KLK12Q9UKR0 248 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 DNAH11Q96DT5 4516 aa14.72□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 COTL1Q14019 142 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 UQCC3Q6UW78 93 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 RMI2Q96E14 147 aa14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PTPRK-222ENST00000532751 A0A087WTM6 91 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1B0GW15 77 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 C16orf90A8MZG2 172 aa14.7□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 RAB4AP20338 218 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 MPV17L2Q567V2 206 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 AMN1Q8IY45 258 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 MRAP2Q96G30 205 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 COX11Q9Y6N1 276 aa14.69□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 Q0VG73 95 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 GAGE6Q13070 117 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 UBE2WQ96B02 151 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 RNF185Q96GF1 192 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM243Q9BU79 118 aa14.68□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 PKHD1P08F94 4074 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 CRPP02741 224 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 MT-ND4LP03901 98 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 S100A8P05109 93 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 CAMPP49913 170 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.67□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 UBE2L6O14933 153 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 AMTP48728 403 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 ST20Q9HBF5 79 aa14.66□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 NCR2O95944 276 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 KRTAP10-2P60368 255 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 Q8N976 141 aa14.65□□□□□ -0.06
PTPRK-222ENST00000532751 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.4 ms