RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531318.1

NFRKB-208, Transcript of nuclear factor related to kappaB binding protein, human

TSL 4

Gene NFRKB, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NFRKB-208	ENST00000531318	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		4.69	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318		F5H697	171 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	PEX7	O00628	323 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	CXorf1	O96002	111 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	CRIP1	P50238	77 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	RBX1	P62877	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.68	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	PKIA	P61925	76 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	DNLZ	Q5SXM8	178 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	RAB4B	P61018	213 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	UBE2G1	P62253	170 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	REG3A	Q06141	175 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.66	□□□□□ -1.66
NFRKB-208	ENST00000531318	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318		A0A1W2PRE2	83 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	MB	P02144	154 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	SLPI	P03973	132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	COX6A2	Q02221	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF471	Q9BX82	626 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318		A0A0J9YXV3	536 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	MGP	P08493	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	AKR1C3	P42330	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	SULT1A2	P50226	295 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	SERF2	P84101	59 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	ZNF726P1	Q15940	193 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	STPG4	Q8N801	248 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	MED28	Q9H204	178 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	UBE2L6	O14933	153 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318		P01737	135 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	TMEM243	Q9BU79	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	LTA	P01374	205 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.61	□□□□□ -1.67
NFRKB-208	ENST00000531318	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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