RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529795.1

PACS1-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 448 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-210ENST00000529795 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 GZMBP10144 247 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 Q0VG73 95 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 OCC1Q8TAD7 63 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 Q9UF83 564 aa8.54□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 A8MWL6 223 aa8.53□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 TMEM262E9PQX1 116 aa8.53□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 NTF3P20783 257 aa8.53□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 FRZBQ92765 325 aa8.53□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.53□□□□□ -1.04
PACS1-210ENST00000529795 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 MGPP08493 103 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 TEX261Q6UWH6 196 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 FAM231DQ6ZW35 169 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 BORCS7Q96B45 105 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 FAM210AQ96ND0 272 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 CNFNQ9BYD5 112 aa8.52□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 HERC2O95714 4834 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 CTRLP40313 264 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 CEBPGP53567 150 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 TWIST1Q15672 202 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 RASL11AQ6T310 242 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 SMIM7Q9BQ49 75 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 KLK12Q9UKR0 248 aa8.51□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 M0QY20 66 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 CRPP02741 224 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 GCSHP23434 173 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 FAM74A3Q4VXF1 159 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 CT83Q5H943 113 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 NIT2Q9NQR4 276 aa8.5□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 FAM231BA6NCW3 169 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 ZNF727A8MUV8 499 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 K7EN84 100 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 Q8N814 137 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 UBE2WQ96B02 151 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 SMDT1Q9H4I9 107 aa8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GVG6 124 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 IQCJQ1A5X6 159 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 C14orf177Q52M58 125 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 Q8N976 141 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.48□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 PEA15Q15121 130 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 MIAQ16674 131 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 OSTCQ9NRP0 149 aa8.47□□□□□ -1.05
PACS1-210ENST00000529795 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 COTL1Q14019 142 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 LINC01551Q86U37 167 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 Q8N1X5 172 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 Q8N3U1 123 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 TMEM70Q9BUB7 260 aa8.46□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 UBE2L6O14933 153 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 TSKUQ8WUA8 353 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 TMEM243Q9BU79 118 aa8.45□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GUT8 65 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GUV1 79 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 MPV17L2Q567V2 206 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 GTSF1Q8WW33 167 aa8.44□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.43□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 NCR2O95944 276 aa8.43□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 RBX1P62877 108 aa8.43□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 BAALCQ8WXS3 180 aa8.43□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 NAT8Q9UHE5 227 aa8.43□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 RYR1P21817 5038 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 HIGD1CA8MV81 97 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 PPP1R17O96001 155 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 AMTP48728 403 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP10-1P60331 282 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 GAGE6Q13070 117 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 RIGQ13278 110 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 ENHOQ6UWT2 76 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 GATD1Q8NB37 220 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 PRR34Q9NV39 138 aa8.42□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.41□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 H7C423 109 aa8.41□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.41□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 EPM2AB3EWF7 344 aa8.4□□□□□ -1.06
PACS1-210ENST00000529795 LECT2O14960 151 aa8.4□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.5 ms