RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523062.1

CSMD1-211, Transcript of CUB and Sushi multiple domains 1, human

TSL 3

Gene CSMD1, Length 764 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSMD1-211	ENST00000523062	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	MUC4	Q99102	2169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062		A8MWV9	139 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062		H0Y8G0	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	RHOD	O00212	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	ATP5L	O75964	103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	CRYGD	P07320	174 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	HTN1	P15515	57 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	DEFA6	Q01524	100 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	F8	P00451	2351 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062		H7C1H1	209 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062		M0QY20	66 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	TCAP	O15273	167 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	NUDT3	O95989	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	IL17D	Q8TAD2	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	NF1	P21359	2839 aa		4.96	□□□□□ -1.61
CSMD1-211	ENST00000523062	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	LINC01549	A6NIU2	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	VCY	O14598	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	G0S2	P27469	103 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	POLR2K	P53803	58 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	RNASE8	Q8TDE3	154 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	KIR2DL4	Q99706	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	RS1	O15537	224 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	RHOH	Q15669	191 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TOMM6	Q96B49	74 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	hDV102S1	A0JD36	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	PRM2	P04554	102 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	PRSS1	P07477	247 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	IGLC3	P0DOY3	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	IGLL1	P15814	213 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	AZU1	P20160	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	RRN3P1	Q2M238	152 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	MAJIN	Q3KP22	176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	ZFP2	Q6ZN57	461 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	MRPL52	Q86TS9	123 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	IGHV3-53	P01767	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	ODF1	Q14990	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		Q6ZN92	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		A0A087WX48	190 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062		I3L3M4	83 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CSMD1-211	ENST00000523062	CIDEA	O60543	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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