RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516568.1

RNU6-504P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 504, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-504P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-504P-201ENST00000516568 ERVS71-1P61550 626 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 COTL1Q14019 142 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CARD19Q96LW7 228 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 RPRMQ9NS64 109 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PTPRGP23470 1445 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 NSD3Q9BZ95 1437 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAT3Q8TDW7 4589 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 REV3LO60673 3130 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 RREB1Q92766 1687 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 A0A1B0GW64 132 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PPP5D1E7EU14 171 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 K7EP34 96 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 M0R135 149 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 NIPSNAP2O75323 286 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CRYGSP22914 178 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 HSD11B1P28845 292 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CRYBA4P53673 196 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 B2MP61769 119 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 NPC2P61916 151 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 COX17Q14061 63 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMED2Q15363 201 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ALX1Q15699 326 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMEM170BQ5T4T1 132 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 Q6JHZ5 121 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMEM91Q6ZNR0 172 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PHB2Q99623 299 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 GAPVD1Q14C86 1478 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TECPR2O15040 1411 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 F8VRH5 84 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAM107AO95990 144 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CST2P09228 141 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TPM4P67936 248 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PSPHP78330 225 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CCL7P80098 99 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 LTC4SQ16873 150 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 Q8N8P6 123 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 CCDC32Q9BV29 185 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ARMC1Q9NVT9 282 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRANK1O15050 2925 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 PLXNA2O75051 1894 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 ANK1P16157 1881 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa-0.78□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 GABARAPH6UMI1 98 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 J3QLW9 94 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 ARPC5O15511 151 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 SMIM24O75264 130 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 ATG12O94817 140 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 IFNA1P01562 189 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 APOC3P02656 99 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 RPS17P08708 135 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 S100A11P31949 105 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 TCTAP57738 103 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 TPPP2P59282 170 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 TMED4Q7Z7H5 227 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 SNX29P2Q8IUI4 249 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 FAM24BQ8N5W8 94 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 AMELXQ99217 191 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-504P-201ENST00000516568 HECW1Q76N89 1606 aa-0.79□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms