RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 APLNQ9ULZ1 77 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 A8MWV9 139 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 NXPH4O95158 308 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 ESRGQ1W209 222 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 AP1S3Q96PC3 154 aa4.58□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 A8MWL6 223 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 F8W036 122 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LTAP01374 205 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 NTF3P20783 257 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LGALS9BQ3B8N2 356 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 PLAC8L1A1L4L8 177 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LGALS9CQ6DKI2 356 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 DPH3Q96FX2 82 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LECT2O14960 151 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 OR10G8Q8NGN5 311 aa4.57□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2L6O14933 153 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRGC1P0CF51 173 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FHL2Q14192 279 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 UBE2WQ96B02 151 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM210BQ96KR6 192 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 CRYBA4P53673 196 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 IL36BQ9NZH7 164 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LY96Q9Y6Y9 160 aa4.56□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 KRBOX1C9JBD0 128 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 GAGE6Q13070 117 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 VSIG2Q96IQ7 327 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 HIGD1CA8MV81 97 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 K7EQD1 137 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 CRYGDP07320 174 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 RASL10AQ92737 203 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 Q9UF83 564 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A087WZ39 114 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM250H0YL14 139 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 CRPP02741 224 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 KLK12Q9UKR0 248 aa4.55□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 A8MTW9 85 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 APOC3P02656 99 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TDRG1Q3Y452 100 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FRZBQ92765 325 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 SRP19P09132 144 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 TCTAP57738 103 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 ISOC2Q96AB3 205 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 H7C1H1 209 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 NCR2O95944 276 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 NAT8Q9UHE5 227 aa4.54□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 M0QXV9 152 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 HSBP1O75506 76 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 FCER1GP30273 86 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 NDUFA5Q16718 116 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LYPD5Q6UWN5 251 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 COMMD7Q86VX2 200 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 SMKR1H3BMG3 65 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 MT-ND4LP03901 98 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 Q6ZVQ6 151 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 A0A1B0GUT8 65 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 C9JQL5 133 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 K7EN84 100 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 HLA-DQA1P01909 254 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 RIGQ13278 110 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.53□□□□□ -1.68
RRN3P1-201ENST00000514813 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 F2Z2F3 143 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 TTC32Q5I0X7 151 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 LINC01551Q86U37 167 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 Q8N976 141 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 SFRP2Q96HF1 295 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 BTF3L4Q96K17 158 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 CKS2P33552 79 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 C11orf52Q96A22 123 aa4.52□□□□□ -1.69
RRN3P1-201ENST00000514813 DPH3P1Q9H4G8 78 aa4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms