RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 USP17L23D6RBM5 183 aa10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 LTAP01374 205 aa10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 AKR1C3P42330 323 aa10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 MPV17L2Q567V2 206 aa10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa10.61□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 MIAQ16674 131 aa10.6□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.6□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 F5H697 171 aa10.59□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 FHITP49789 147 aa10.59□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa10.59□□□□□ -0.71
ITGA3-211ENST00000508100 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SULT1A2P50226 295 aa10.58□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 RAB5CP51148 216 aa10.58□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.58□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 PRR27Q6MZM9 219 aa10.58□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.58□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 S100A9P06702 114 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 PRSS1P07477 247 aa10.57□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.57□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 FAM213BQ8TBF2 198 aa10.57□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.57□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 RPL19P84098 196 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 C9orf163Q8N9P6 203 aa10.56□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 PAGE4O60829 102 aa10.55□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 CXCL1P09341 107 aa10.55□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SMIM17P0DL12 118 aa10.55□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 CLPSL2Q6UWE3 100 aa10.55□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 DERL1Q9BUN8 251 aa10.55□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SSTP61278 116 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 RBX1P62877 108 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 GAGE6Q13070 117 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 LINC00269Q8N2A0 174 aa10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SNAI2O43623 268 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 OR5AL1P0C617 328 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 BAGE2Q86Y30 109 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SFT2D1Q8WV19 159 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 PRR34Q9NV39 138 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 VAX2Q9UIW0 290 aa10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.53□□□□□ -0.72
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.52□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.52□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 SDIM1Q6ZPB5 146 aa10.51□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 DPH3Q96FX2 82 aa10.51□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 AP1S3Q96PC3 154 aa10.51□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.5□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 SCO2A0A1W2PP80 73 aa10.5□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.5□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 MLST8Q9BVC4 326 aa10.5□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GV50 99 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 hDV102S1A0JD36 115 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 TEX46H3BTG2 121 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 REG3AQ06141 175 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 IQCJQ1A5X6 159 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.49□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 H7C1H1 209 aa10.48□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 PANO1I0J062 215 aa10.48□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 MGPP08493 103 aa10.48□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.48□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.48□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.48□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 P01737 135 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 CNBPP62633 177 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 BLOC1S1P78537 153 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 Q6ZRU5 148 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 TPPP3Q9BW30 176 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 MANBALQ9NQG1 85 aa10.47□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.46□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 CCL20P78556 96 aa10.46□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 TEX261Q6UWH6 196 aa10.46□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.46□□□□□ -0.73
ITGA3-211ENST00000508100 M0QY20 66 aa10.45□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM243Q9BU79 118 aa10.45□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 RPL35P42766 123 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 RNF185Q96GF1 192 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 GNG13Q9P2W3 67 aa10.44□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GUV1 79 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 IFNA1P01562 189 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 MT1HL1P0DM35 61 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 GZMBP10144 247 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 CACNG7P62955 275 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.43□□□□□ -0.74
ITGA3-211ENST00000508100 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.5 ms