RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507116.5

PDE4D-216, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 3,350 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-216ENST00000507116 Q8N6K4 173 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CCL13Q99616 98 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 KLK15Q9H2R5 256 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 CEP192Q8TEP8 1941 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZRP5 223 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00269Q8N2A0 174 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-216ENST00000507116 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 MED13Q9UHV7 2174 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TECTAO75443 2155 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 A6NN06 94 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C22orf24Q9Y442 160 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 USF3Q68DE3 2245 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 RTTNQ86VV8 2226 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ACACAQ13085 2346 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 SOCS3O14543 225 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ENHOQ6UWT2 76 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 CLEC19AQ6UXS0 136 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 FRYLO94915 3013 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 COL4A6Q14031 1691 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0J9YXY3 114 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PSPHP1O15172 72 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ERC2-IT1O76042 136 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 LHBP01229 141 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 CXCL6P80162 114 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF575Q86XF7 245 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 MIAQ16674 131 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM141Q96I45 108 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 A0A0A0MQY5 61 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C5orf67F2Z3F1 127 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-19P01714 112 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C10orf128Q5T292 105 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 MSRB1Q9NZV6 116 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 CACNA1AO00555 2505 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 hDV103S1A0JD37 113 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PLXNB1O43157 2135 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PRCDQ00LT1 54 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 GPHB5Q86YW7 130 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 IGF2RP11717 2491 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 CD59P13987 128 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 FOLR3P41439 243 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 MP68P56378 58 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 LINC00313P59037 77 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM14CQ9P0S9 112 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 DSCAMO60469 2012 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZTC4 211 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ATRXP46100 2492 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 RPL11P62913 178 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01554Q52M75 96 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 LITAFQ99732 161 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PRR14LQ5THK1 2151 aa4.49□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C8orf49Q96NF6 230 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 UBL5Q9BZL1 73 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 NBASA2RRP1 2371 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C16orf90A8MZG2 172 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 C12orf77C9JDV5 145 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PRYO14603 147 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 S100A4P26447 101 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 Q6ZSV7 163 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ZNF407Q9C0G0 2248 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 CCL4P13236 92 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PI4KAP42356 2102 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 FAM27BQ5VT28 67 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ESM1Q9NQ30 184 aa4.48□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 MED14OSP0DP75 135 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 COX14Q96I36 57 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa4.47□□□□□ -1.69
PDE4D-216ENST00000507116 H0YGG7 62 aa4.47□□□□□ -1.69
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