RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.28□□□□□ -0.92
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 KCNIP4Q6PIL6 250 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS10P5Q9NQ39 176 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 FRAS1Q86XX4 4008 aa9.27□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM229AH3BQW9 127 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 S100A8P05109 93 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 S100PP25815 95 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 LYPD5Q6UWN5 251 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 CTDSP1Q9GZU7 261 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 Q9UF83 564 aa9.26□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GW15 77 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 C7orf77A4D0Y5 90 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00315P59091 139 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 HBBP68871 147 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 RHEBQ15382 184 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 C10orf91Q5T1B1 145 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 RASL11AQ6T310 242 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 SVBPQ8N300 66 aa9.25□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 HERC2O95714 4834 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 M0QY20 66 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 M0R2N4 97 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 SNAPINO95295 136 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 AMN1Q8IY45 258 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 BTF3L4Q96K17 158 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa9.23□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 GATD1Q8NB37 220 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAJC30Q96LL9 226 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 IMMP2LQ96T52 175 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 Q9H8V8 135 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 NIT2Q9NQR4 276 aa9.22□□□□□ -0.93
PGGT1B-204ENST00000503638 NCR2O95944 276 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB4AP20338 218 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2D3P61077 147 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2D2P62837 147 aa9.21□□□□□ -0.94
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PGGT1B-204ENST00000503638 MRAP2Q96G30 205 aa9.21□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 KMT2AQ03164 3969 aa9.21□□□□□ -0.94
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PGGT1B-204ENST00000503638 LINC00694P0DN24 101 aa9.2□□□□□ -0.94
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PGGT1B-204ENST00000503638 WFDC10BQ8IUB3 73 aa9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A1B0GXF2 115 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 CKS2P33552 79 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TIRAPP58753 221 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF185Q96GF1 192 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 UPK3BQ9BT76 320 aa9.19□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 ST20Q9HBF5 79 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM242Q9NWH2 141 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.18□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TTC32Q5I0X7 151 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 FRZBQ92765 325 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 CHCHD5Q9BSY4 110 aa9.17□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 D6R8Y8 96 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM262E9PQX1 116 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 GAS8-AS1O95177 125 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 PPP1R17O96001 155 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-30P01768 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-33P01772 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 PMCHP20382 165 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS10P46783 165 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 COTL1Q14019 142 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TMEM97Q5BJF2 176 aa9.16□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 A0A087WX48 190 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.15□□□□□ -0.94
PGGT1B-204ENST00000503638 UBE2L6O14933 153 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 AMTP48728 403 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 ORMDL3Q8N138 153 aa9.14□□□□□ -0.95
PGGT1B-204ENST00000503638 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.14□□□□□ -0.95
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