RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496024.1

CALD1-223, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 4

Gene CALD1, Length 557 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3-33	P01772	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2D3	P61077	147 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2D2	P62837	147 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	TSKU	Q8WUA8	353 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	BORCS7	Q96B45	105 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	TNP2	Q05952	138 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024		Q8N3U1	123 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	CNFN	Q9BYD5	112 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	PKD1	P98161	4303 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024		A0A087WWC5	75 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1B0GUT8	65 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024		H7C1H1	209 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024		M0QY20	66 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	RASL11A	Q6T310	242 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	NUP35	Q8NFH5	326 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	GATD1	Q8NB37	220 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024		Q9HAA7	133 aa		6.65	□□□□□ -1.34
CALD1-223	ENST00000496024	PKHD1	P08F94	4074 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	FAM231B	A6NCW3	169 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM262	E9PQX1	116 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	RIG	Q13278	110 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	NIT2	Q9NQR4	276 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		6.64	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	COMMD7	Q86VX2	200 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	NIT1	Q86X76	327 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024		A0A087WX48	190 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024		A0A1B0GVY2	172 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024		F8W036	122 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024		K7EP13	123 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	CAMP	P49913	170 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	NFE4	Q86UQ8	179 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	AMN1	Q8IY45	258 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	GAS8-AS1	O95177	125 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	BTF3	P20290	206 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	RAB4A	P20338	218 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	GAGE6	Q13070	117 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	UQCC3	Q6UW78	93 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	RNF185	Q96GF1	192 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	KLK12	Q9UKR0	248 aa		6.61	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM218	A2RU14	115 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	SMKR1	H3BMG3	65 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	PPP1R2P9	O14990	202 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	PSCA	O43653	123 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	NCR2	O95944	276 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	MT-ND4L	P03901	98 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	ADCYAP1	P18509	176 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	AMT	P48728	403 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	COTL1	Q14019	142 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	MPV17L2	Q567V2	206 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	ATRAID	Q6UW56	229 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	FRZB	Q92765	325 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	UBE2W	Q96B02	151 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CALD1-223	ENST00000496024	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	LINC00862	A6NCI5	91 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	PMCH	P20382	165 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	HBB	P68871	147 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	LAGE3	Q14657	143 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	ELOB	Q15370	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	MRPL51	Q4U2R6	128 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	SPATA12	Q7Z6I5	190 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024		Q8N976	141 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	MRAP2	Q96G30	205 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CALD1-223	ENST00000496024	TMEM243	Q9BU79	118 aa		6.58	□□□□□ -1.36

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