RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 APOMO95445 188 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 FAM74A4Q5TZK3 123 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 Q8N1Y9 231 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 TM2D2Q9BX73 214 aa9.53□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 SUMO4Q6EEV6 95 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 ZFP2Q6ZN57 461 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 NFE4Q86UQ8 179 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.52□□□□□ -0.88
PRAME-213ENST00000492657 JMJD1CQ15652 2540 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 LGALS9O00182 355 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TOMM6Q96B49 74 aa9.52□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 F8W1H4 67 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PRM2P04554 102 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PRO0461Q9UI25 63 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 OR11H12B2RN74 326 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 OR11H1Q8NG94 326 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 OR11H2Q8NH07 326 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SPATA25Q9BR10 227 aa9.51□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DRB4P13762 266 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 POM121L12Q8N7R1 296 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 HTN1P15515 57 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PSMB2P49721 201 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SCGB2A2Q13296 93 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RNF152Q8N8N0 203 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 C9orf85Q96MD7 179 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PRSS29PA6NIE9 313 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RBMY1CP0DJD4 496 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 DEFB131AP59861 70 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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PRAME-213ENST00000492657 WFDC11Q8NEX6 87 aa9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PDZD2O15018 2839 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 J3QR89 54 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SPINK8P0C7L1 97 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RRN3P1Q2M238 152 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 LINC01549A6NIU2 74 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 XGP55808 180 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 BAALCQ8WXS3 180 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 ODF3Q96PU9 254 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 KIR2DL4Q99706 377 aa9.49□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.48□□□□□ -0.89
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PRAME-213ENST00000492657 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa9.48□□□□□ -0.89
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PRAME-213ENST00000492657 CDIP1Q9H305 208 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.48□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 CRYGDP07320 174 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TMEM61Q8N0U2 210 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 Q8N2B8 174 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SDHAF1A6NFY7 115 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 LINC01619G3V211 115 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TSHBP01222 138 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 FOXI1Q12951 378 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 ZNF56Q15929 161 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TAL2Q16559 108 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PRADC1Q9BSG0 188 aa9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.46□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 PPP1R17O96001 155 aa9.46□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.46□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.46□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
PRAME-213ENST00000492657 ZNF876PQ49A33 203 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 RNF183Q96D59 192 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.46□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 ZNF815PA8K554 130 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 M0QY20 66 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 SCGB1A1P11684 91 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 NACAE9PAV3 2078 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 VCYO14598 125 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZSV7 163 aa9.45□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 H3BMM0 161 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PRX2 142 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 PROK1P58294 105 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP9.44□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 UNC79Q9P2D8 2635 aa9.44□□□□□ -0.9
PRAME-213ENST00000492657 IGIPA6NJ69 53 aa9.43□□□□□ -0.9
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