RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489048.1

NEB-215, Transcript of nebulin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEB, Length 2,738 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEB-215ENST00000489048 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.1□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 SPTBN2O15020 2390 aa8.1□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 K7EQG2 157 aa8.1□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 PSMB8P28062 276 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 MED13LQ71F56 2210 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 A0A0J9YXY3 114 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 TMEM89A2RUT3 159 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 RAX2Q96IS3 184 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 LITAFQ99732 161 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 ZFHX3Q15911 3703 aa8.09□□□□□ -1.11
NEB-215ENST00000489048 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.09□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 A0A0J9YXV3 536 aa8.09□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.09□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 ATXN8Q156A1 80 aa8.09□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 CITED1Q99966 193 aa8.09□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TRGV11A0A075B6L2 103 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 C9JAW5 83 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 C19orf84I3L1E1 186 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 FAM104AQ969W3 186 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 MUC6Q6W4X9 2439 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.08□□□□□ -1.12
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NEB-215ENST00000489048 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 SPANXCQ9NY87 97 aa8.08□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 LINC01620Q4KN68 170 aa8.07□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.07□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 RNF183Q96D59 192 aa8.06□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 PKD1L2Q7Z442 2459 aa8.06□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.06□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.06□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 CLUHP3Q96NS8 147 aa8.06□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.06□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.05□□□□□ -1.12
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NEB-215ENST00000489048 SPTA1P02549 2419 aa8.05□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.05□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 MSMBP08118 114 aa8.05□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 CD28P10747 220 aa8.05□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.05□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.04□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 A8MTW9 85 aa8.04□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TRIAP1O43715 76 aa8.04□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 IGKV3-20P01619 116 aa8.04□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TEX29Q8N6K0 151 aa8.04□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 Q1RN00 199 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 Q6Q795 121 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 CEP295Q9C0D2 2601 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 H7C2G1 150 aa8.03□□□□□ -1.12
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NEB-215ENST00000489048 CCL19Q99731 98 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 SPXQ9BT56 116 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.03□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.02□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 TIMM17BO60830 172 aa8.02□□□□□ -1.12
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NEB-215ENST00000489048 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.02□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.02□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.02□□□□□ -1.12
NEB-215ENST00000489048 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.02□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 H3BT86 120 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 AVPP01185 164 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 Q5PR19 223 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 CHCHD7Q9BUK0 85 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 GATA3P23771 443 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 H3BMM0 161 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 C10orf99Q6UWK7 81 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 UBE2WQ96B02 151 aa8.01□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.01□□□□□ -1.13
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NEB-215ENST00000489048 IFITM1P13164 125 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 B4DSR2 109 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 PLA2G2AP14555 144 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 SYNJ2BPP57105 145 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 DEFB121Q5J5C9 76 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 SVIPQ8NHG7 77 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 BAHCC1Q9P281 2608 aa8□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
NEB-215ENST00000489048 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.99□□□□□ -1.13
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