RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488279.6

PTPN4-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 4, humanhuman

TSL 5

Gene PTPN4, Length 662 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN4-211ENST00000488279 RAB5CP51148 216 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
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PTPN4-211ENST00000488279 DERL1Q9BUN8 251 aa14.84□□□□□ -0.03
PTPN4-211ENST00000488279 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
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PTPN4-211ENST00000488279 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.83□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 C1orf43Q9BWL3 253 aa14.83□□□□□ -0.04
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PTPN4-211ENST00000488279 AP1S3Q96PC3 154 aa14.82□□□□□ -0.04
PTPN4-211ENST00000488279 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa14.82□□□□□ -0.04
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PTPN4-211ENST00000488279 MPV17L2Q567V2 206 aa14.81□□□□□ -0.04
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PTPN4-211ENST00000488279 CLRN3Q8NCR9 226 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 OCC1Q8TAD7 63 aa14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PTPN4-211ENST00000488279 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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PTPN4-211ENST00000488279 CNFNQ9BYD5 112 aa14.61□□□□□ -0.07
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