RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 METTL26Q96S19 204 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 CNFNQ9BYD5 112 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PSG8Q9UQ74 426 aa8.41□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 C7orf71A4D174 169 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 ORMDL3Q8N138 153 aa8.4□□□□□ -1.06
RABGEF1-207ENST00000484547 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.4□□□□□ -1.06
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGKV1-17P01599 117 aa8.39□□□□□ -1.07
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RABGEF1-207ENST00000484547 H3BMM0 161 aa8.35□□□□□ -1.07
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RABGEF1-207ENST00000484547 K7EMI3 77 aa8.31□□□□□ -1.08
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RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 BUB3O43684 328 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 CKS2P33552 79 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 ODF1Q14990 250 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 AMN1Q8IY45 258 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.3□□□□□ -1.08
RABGEF1-207ENST00000484547 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.29□□□□□ -1.08
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