RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A087WW49 117 aa13.15□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H3BQ85 93 aa13.14□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MP68P56378 58 aa13.14□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV2-8P01709 118 aa13.13□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GDF5OSQ5U4N7 250 aa13.13□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.13□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLPSL1A2RUU4 121 aa13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEFB113Q30KQ7 82 aa13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ESM1Q9NQ30 184 aa13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NRGNQ92686 78 aa13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RNF183Q96D59 192 aa13.12□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLV1-47P01700 117 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q6ZUT4 128 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MDFICQ9P1T7 246 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TIRAPP58753 221 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRORYQ9H606 182 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DENND4AQ7Z401 1863 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MED13Q9UHV7 2174 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q8N7P7 452 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP5G1P05496 136 aa13.11□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 K7EMT4 169 aa13.1□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P0C879 139 aa13.1□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZMAT4Q9H898 229 aa13.1□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C14orf132Q9NPU4 83 aa13.1□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TP73-AS1Q9UF72 201 aa13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HHLA3Q9XRX5 114 aa13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MIAQ16674 131 aa13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT-ATP8P03928 68 aa13.09□□□□□ -0.31
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFA1O15239 70 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDH15Q96QU1 1955 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LINC00643Q86TS7 51 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.08□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFB1O75438 58 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C9orf66Q5T8R8 295 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DIRC1Q969H9 104 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM131Q92545 1883 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACACBO00763 2458 aa13.07□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0J9YXY3 114 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CXCL5P42830 114 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FANCD2OSQ96PS1 177 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GPHB5Q86YW7 130 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRBV12-3P01733 135 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIGD2BQ4VC39 106 aa13.06□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRSQ13332 1948 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.05□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPAG11BQ08648 103 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 Q6ZPA2 131 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSMPQ1L6U9 139 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DYSFO75923 2080 aa13.04□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 A0A0J9YX75 114 aa13.03□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 C10orf105Q8TEF2 133 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 BRK1Q8WUW1 75 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SPATA25Q9BR10 227 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa13.02□□□□□ -0.32
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IGLC6P0CF74 106 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 P0DMU3 169 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM231AP0DMU4 169 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FAM231CP0DMU5 169 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UPK3BQ9BT76 320 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIEZO1Q92508 2521 aa13.02□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 YPEL4Q96NS1 127 aa13.01□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MLST8Q9BVC4 326 aa13.01□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TM2D2Q9BX73 214 aa13.01□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ALPK3Q96L96 1907 aa13.01□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NOTCH2Q04721 2471 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SIRPDQ9H106 197 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PKIGQ9Y2B9 76 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROP1O75360 226 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDIM1Q6ZPB5 146 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCDC140Q96MF4 163 aa13□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CACNA1AO00555 2505 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DEFB4AO15263 64 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCL18P55774 89 aa12.99□□□□□ -0.33
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MBD6Q96DN6 1003 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 139 ms