RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	XKRY2	A2RUG3	117 aa		7.44	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF727	A8MUV8	499 aa		7.44	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	C16orf90	A8MZG2	172 aa		7.44	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		M0QY20	66 aa		7.44	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATC	O43716	136 aa	Known RBP	7.44	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WTM6	91 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		F2Z2F3	143 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7EP13	123 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM17	P0DL12	118 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ERVFC1-1	P60608	527 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	WFDC2	Q14508	124 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NIT1	Q86X76	327 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		7.43	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WWC5	75 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV26-2	A0A0B4J265	109 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	NFE4	Q86UQ8	179 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		7.42	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRCOL1	A6NCL2	159 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRGC1	P0CF51	173 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL23	P62829	140 aa	Known RBP	7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	LAGE3	Q14657	143 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	TWIST1	Q15672	202 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	MPV17L2	Q567V2	206 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	CT83	Q5H943	113 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	ISOC2	Q96AB3	205 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959		V9GYV3	84 aa		7.41	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	OSTC	Q9NRP0	149 aa		7.4	□□□□□ -1.22
GTPBP1-208	ENST00000475959	HIGD1C	A8MV81	97 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959		A8MWL6	223 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAS8-AS1	O95177	125 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADIRF	Q15847	76 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR73	Q6P4I2	378 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	RASL11A	Q6T310	242 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q8N976	141 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	TSKU	Q8WUA8	353 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLK12	Q9UKR0	248 aa		7.39	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSCA	O43653	123 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	NAT8	Q9UHE5	227 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	HSPG2	P98160	4391 aa		7.38	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959		H7C1H1	209 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	LECT2	O14960	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	GAGE6	Q13070	117 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	PEA15	Q15121	130 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM241	Q24JQ0	296 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE2W	Q96B02	151 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		7.37	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A087WX48	190 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP10-1	P60331	282 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFITM2	Q01629	132 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATRAID	Q6UW56	229 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	ENHO	Q6UWT2	76 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q8N814	137 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	RNF185	Q96GF1	192 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	NIT2	Q9NQR4	276 aa		7.36	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1B0GUT8	65 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	EREG	O14944	169 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDK2AP2	O75956	126 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	RBX1	P62877	108 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUP35	Q8NFH5	326 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		7.35	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMKR1	H3BMG3	65 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCR2	O95944	276 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS10	P46783	165 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMN1	Q8IY45	258 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.34	□□□□□ -1.23
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM231B	A6NCW3	169 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	HAMP	P81172	84 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM97	Q5BJF2	176 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	BORCS7	Q96B45	105 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		7.33	□□□□□ -1.24
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMDT1	Q9H4I9	107 aa		7.33	□□□□□ -1.24

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