RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q86TA4 180 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C11orf72Q8NBR9 251 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C20orf144Q9BQM9 153 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.77□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 AKR1C3P42330 323 aa5.76□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q6AWC8 147 aa5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDFIP1Q9BT67 221 aa5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DERL1Q9BUN8 251 aa5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.75□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F5H768 121 aa5.75□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBE2G1P62253 170 aa5.75□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.75□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.75□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 RAB19A4D1S5 217 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0R036 132 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SH2D1AO60880 128 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LY6G6CO95867 125 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT3P25713 68 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FMC1Q96HJ9 113 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 APLNQ9ULZ1 77 aa5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRGV2A0A075B6R0 118 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A0J9YY99 117 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LCE6AA0A183 80 aa5.73□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.73□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LTAP01374 205 aa5.73□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PMCHP20382 165 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CEBPGP53567 150 aa5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7orf33Q8WU49 177 aa5.72□□□□□ -1.49
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MED9Q9NWA0 146 aa5.72□□□□□ -1.49
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 B4DEV8 164 aa5.71□□□□□ -1.5
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 BAGE2Q86Y30 109 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 VAX2Q9UIW0 290 aa5.71□□□□□ -1.5
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC4Q99102 2169 aa5.71□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NACAE9PAV3 2078 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRBOX1C9JBD0 128 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BVH4 76 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 IGLV2-8P01709 118 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KIAA0087Q14695 138 aa5.7□□□□□ -1.5
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TEX261Q6UWH6 196 aa5.7□□□□□ -1.5
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