RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-30P01768 117 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-33P01772 117 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 LINC00311Q8N616 119 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 H3BRN7 92 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.03□□□□□ -0.96
CCBE1-202ENST00000439986 MED13Q9UHV7 2174 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 DKK2Q9UBU2 259 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 GTF3C1Q12789 2109 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 J3QKU1 62 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PRM2P04554 102 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PATE2Q6UY27 113 aa9.02□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 SPRNQ5BIV9 151 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 P0C879 139 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFS7O75251 213 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV4-59P01825 116 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 SLURP1P55000 103 aa9.01□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PCP2Q8IVA1 136 aa9□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 K7EM74 188 aa9□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa9□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 DEFB112Q30KQ8 113 aa9□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 NDUFA4O00483 81 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 LCA10Q71F78 164 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 A0A0A0MQY5 61 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 C5orf38Q86SI9 138 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PLCE1Q9P212 2302 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 GATA3P23771 443 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 GTSF1Q8WW33 167 aa8.99□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 K7EMI3 77 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 DEFB4AO15263 64 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 NCR3O14931 201 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 LINC01620Q4KN68 170 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 KMT2EQ8IZD2 1858 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.98□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 DYNAPQ8N1N2 210 aa8.97□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP8.97□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.97□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.96□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.96□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 F8W735 103 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.97
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF503Q96F45 646 aa8.96□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 C2orf16Q68DN1 1984 aa8.96□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 C2orf70A6NJV1 201 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 F8VRH5 84 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 CTSZQ9UBR2 303 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 PLA2G2AP14555 144 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 NPBQ8NG41 125 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 Q9H8V8 135 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa8.95□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 RITA1Q96K30 269 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 E7EUB6 86 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 IGKV1-17P01599 117 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 IGLV2-8P01709 118 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 KAAG1Q9UBP8 84 aa8.94□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 Q9UF83 564 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TTC28Q96AY4 2481 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 PIFOQ8TCI5 191 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TNCP24821 2201 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa8.93□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 LTBP2Q14767 1821 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 COX7B2Q8TF08 81 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM131Q92545 1883 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 MED12LQ86YW9 2145 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.92□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 GDF5OSQ5U4N7 250 aa8.91□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.91□□□□□ -0.98
CCBE1-202ENST00000439986 I3L2K1 104 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms