RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428861.1

ATG4B-210, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-210ENST00000428861 NFE4Q86UQ8 179 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM7Q9BQ49 75 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 CNFNQ9BYD5 112 aa7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WTM6 91 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 XKRY2A2RUG3 117 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 GATCO43716 136 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 MGPP08493 103 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 SMIM17P0DL12 118 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 NIT1Q86X76 327 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 Q9HAA7 133 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WWC5 75 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 ZNF727A8MUV8 499 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 ERVFC1-1P60608 527 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 TWIST1Q15672 202 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 WDR73Q6P4I2 378 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 TRGC1P0CF51 173 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 WFDC2Q14508 124 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 LAGE3Q14657 143 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.15□□□□□ -1.26
ATG4B-210ENST00000428861 A8MWL6 223 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 GAS8-AS1O95177 125 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 MPV17L2Q567V2 206 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 CT83Q5H943 113 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 GATD1Q8NB37 220 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 ISOC2Q96AB3 205 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 OSTCQ9NRP0 149 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 KLK12Q9UKR0 248 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 V9GYV3 84 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM241Q24JQ0 296 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 RASL11AQ6T310 242 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TSKUQ8WUA8 353 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 HIGD1CA8MV81 97 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM262E9PQX1 116 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 PSCAO43653 123 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 GAGE6Q13070 117 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 PEA15Q15121 130 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 FAM74A3Q4VXF1 159 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N976 141 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 NIT2Q9NQR4 276 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 A0A087WX48 190 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 H7C1H1 209 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 EREGO14944 169 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 LECT2O14960 151 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 KRTAP10-1P60331 282 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 ADIRFQ15847 76 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 IQCJQ1A5X6 159 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 ENHOQ6UWT2 76 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 Q8N814 137 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 NUP35Q8NFH5 326 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 UBE2WQ96B02 151 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 RNF185Q96GF1 192 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 NAT8Q9UHE5 227 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 CDK2AP2O75956 126 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 RBX1P62877 108 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 IFITM2Q01629 132 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 BAALCQ8WXS3 180 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 FAT1Q14517 4588 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.1□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 A0A1B0GUT8 65 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 FAM231BA6NCW3 169 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 TM2D2Q9BX73 214 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4B-210ENST00000428861 ANGP03950 147 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 AMN1Q8IY45 258 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.08□□□□□ -1.28
ATG4B-210ENST00000428861 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.4 ms