RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 VCYO14598 125 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 CFHR3Q02985 330 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM238C9JI98 176 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 PMVKQ15126 192 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.9□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01549A6NIU2 74 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 DSCR9P59020 149 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MDFICQ9P1T7 246 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EMT4 169 aa13.89□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 HERVK_113P61574 105 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM170BQ5T4T1 132 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 A6NJY4 79 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PRO0461Q9UI25 63 aa13.88□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 APOMO95445 188 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF56Q15929 161 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 GTSF1LQ9H1H1 148 aa13.87□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM141Q96I45 108 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNRF2Q8NHG8 242 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS9O00182 355 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMB8P28062 276 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 Q8N1Y9 231 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TIMM17AQ99595 171 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YY99 117 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QR89 54 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2D1P51668 147 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINK13Q1W4C9 94 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 INSL3P51460 131 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 C9orf85Q96MD7 179 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0J9YX75 114 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPAN13O95857 204 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 SAMD13Q5VXD3 122 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP1-202ENST00000417536 C2CD3Q4AC94 2353 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 AZU1P20160 251 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF876PQ49A33 203 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 M0QY20 66 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SYT8Q8NBV8 401 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 PSMB2P49721 201 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SIGMAR1Q99720 223 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SYNJ2BPP57105 145 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EQG2 157 aa13.8□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QQQ9 107 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 GATA3P23771 443 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ODF3Q96PU9 254 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-30P01768 117 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.79□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 P0DMU3 169 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM231AP0DMU4 169 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM231CP0DMU5 169 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP126Q5VTH2 177 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP13.78□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 AMELXQ99217 191 aa13.77□□□□□ -0.2
SH3BP1-202ENST00000417536 CFC1BP0CG36 223 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 CFC1P0CG37 223 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 HTN1P15515 57 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF580Q9UK33 172 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2D3P61077 147 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2D2P62837 147 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa13.77□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 HIVEP2P31629 2446 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA25Q9BR10 227 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 RHOHQ15669 191 aa13.76□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 SMR3AQ99954 134 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 NFE4Q86UQ8 179 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 NACAE9PAV3 2078 aa13.75□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 PTH2Q96A98 100 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 I3L3M4 83 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 FOXI1Q12951 378 aa13.74□□□□□ -0.21
SH3BP1-202ENST00000417536 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa13.74□□□□□ -0.21
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