RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EVI2AP22794 236 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.49□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GUT8 65 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R2P9O14990 202 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LELP1Q5T871 98 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KMT2AQ03164 3969 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MUC4Q99102 2169 aa10.48□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0R2N4 97 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MGPP08493 103 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FRZBQ92765 325 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.47□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM218A2RU14 115 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00862A6NCI5 91 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 M0QY20 66 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2D3P61077 147 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBE2D2P62837 147 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP35Q8NFH5 326 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 Q9UF83 564 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RIGQ13278 110 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10J3Q5JRS4 329 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COMMD7Q86VX2 200 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GW15 77 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MT-ND4LP03901 98 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RASL11AQ6T310 242 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM191AQ9H0A3 160 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC11CQ9BY50 192 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NIT2Q9NQR4 276 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8W036 122 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C6orf223Q8N319 242 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AP5S1Q9NUS5 200 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A8P05109 93 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLRN3Q8NCR9 226 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADCYAP1P18509 176 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKIAP61925 76 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RTL8CO15255 209 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GATD1Q8NB37 220 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRAP2Q96G30 205 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDIP1Q9H305 208 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NFE4Q86UQ8 179 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 H3BS24 57 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PPP1R17O96001 155 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB4AP20338 218 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HBBP68871 147 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IMMP2LQ96T52 175 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1B0GXF2 115 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LAGE3Q14657 143 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQCJQ1A5X6 159 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NIT1Q86X76 327 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AMN1Q8IY45 258 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF185Q96GF1 192 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH2Q9P225 4427 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS29PA6NIE9 313 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CAMPP49913 170 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELOBQ15370 118 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM104BQ5XKR9 115 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A087WX48 190 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BTF3L4Q96K17 158 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM242Q9NWH2 141 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NCR2O95944 276 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-30P01768 117 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-33P01772 117 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms