RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393503.2

CNGA3-202, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene CNGA3, Length 569 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-202ENST00000393503 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 PAGE4O60829 102 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 SLPIP03973 132 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF56Q15929 161 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 C14orf177Q52M58 125 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 CST9LP1Q5W188 147 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 VAX2Q9UIW0 290 aa8.49□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 CRPP02741 224 aa8.48□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 AKR1C3P42330 323 aa8.48□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 GAGE6Q13070 117 aa8.48□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.48□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.48□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 SMLR1H3BR10 107 aa8.47□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 SSTP61278 116 aa8.47□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 MIAQ16674 131 aa8.47□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.47□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 RNF213Q63HN8 5207 aa8.47□□□□□ -1.05
CNGA3-202ENST00000393503 A0A1B0GV50 99 aa8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 CXCL1P09341 107 aa8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 OR5AL1P0C617 328 aa8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 TCEAL7Q9BRU2 100 aa8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.45□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 ARPC5O15511 151 aa8.45□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 CHTF8P0CG12 524 aa8.45□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 DERL1Q9BUN8 251 aa8.45□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 M0QY20 66 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 GZMBP10144 247 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 ODF1Q14990 250 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 IQCJQ1A5X6 159 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 BAGE2Q86Y30 109 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 STOML3Q8TAV4 291 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 MBD3L1Q8WWY6 194 aa8.44□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 F5H697 171 aa8.43□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.43□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 SFT2D1Q8WV19 159 aa8.43□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 IGLC6P0CF74 106 aa8.42□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 CCL20P78556 96 aa8.42□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 REG3AQ06141 175 aa8.42□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.42□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 FAM213BQ8TBF2 198 aa8.42□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.41□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 A0A087WYN8 130 aa8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 RAB5CP51148 216 aa8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 TMUB2Q71RG4 321 aa8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 KCNRGQ8N5I3 272 aa8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 AP1S3Q96PC3 154 aa8.4□□□□□ -1.06
CNGA3-202ENST00000393503 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 hDV102S1A0JD36 115 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 MGPP08493 103 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 PKIAP61925 76 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 Q6ZRU5 148 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 C15orf56Q8N910 161 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.39□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.38□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 C11orf52Q96A22 123 aa8.38□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 A0A1B0GUV1 79 aa8.37□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 TPPP3Q9BW30 176 aa8.37□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.37□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 RAB19A4D1S5 217 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 PHOX2AO14813 284 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 SMIM17P0DL12 118 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 ZNF345Q14585 488 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 RGS21Q2M5E4 152 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 CENPWQ5EE01 88 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 TMEM243Q9BU79 118 aa8.36□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 A0A0D9SG52 128 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 UMAD1C9J7I0 102 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 PFDN1O60925 122 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 P01737 135 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 BCL2L11O43521 198 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 COX6A2Q02221 97 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 RASL11AQ6T310 242 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.34□□□□□ -1.07
CNGA3-202ENST00000393503 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-202ENST00000393503 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.33□□□□□ -1.08
CNGA3-202ENST00000393503 RNF185Q96GF1 192 aa8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.7 ms