RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCN3BQ9NY72 215 aa-1.32□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM92AA1XBS5 289 aa-1.33□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 J3KT08 172 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMIM6P0DI80 62 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 GNG10P50151 68 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q5VV11 94 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 TMEM244Q5VVB8 128 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 CDC26Q8NHZ8 85 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDUFA12Q9UI09 145 aa-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP-1.34□□□□□ -2.62
RNU6-38P-201ENST00000384085 PARP14Q460N5 1801 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLCE1Q9P212 2302 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 HERC1Q15751 4861 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 CFAP126Q5VTH2 177 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-1.35□□□□□ -2.63
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RNU6-38P-201ENST00000384085 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFT172Q9UG01 1749 aa-1.35□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 A0A1B0GV72 72 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 BCE1O60756 84 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 HAMPP81172 84 aa-1.36□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 DCDP81605 110 aaKnown RBP-1.36□□□□□ -2.63
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RNU6-38P-201ENST00000384085 S100GP29377 79 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 S100A3P33764 101 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 BAGE3Q86Y29 109 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 C10orf82Q8WW14 230 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPRMQ9NS64 109 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERCC6Q03468 1493 aa-1.37□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2D1P51668 147 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-1.38□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 USF3Q68DE3 2245 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLPSL1A2RUU4 121 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 TCTE3Q8IZS6 198 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 CREBBPQ92793 2442 aa-1.39□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 CMPK1P30085 196 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPAG11AQ6PDA7 123 aa-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-1.4□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERCC6L2Q5T890 1561 aa-1.41□□□□□ -2.63
RNU6-38P-201ENST00000384085 A6NIN4 97 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 TNFSF15O95150 251 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 IFNA17P01571 189 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 SMPXQ9UHP9 88 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRP6O75581 1613 aa-1.41□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 WNK3Q9BYP7 1800 aa-1.42□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 PIRTP0C851 137 aa-1.42□□□□□ -2.64
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RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-1.43□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 SCTP09683 121 aa-1.43□□□□□ -2.64
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RNU6-38P-201ENST00000384085 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa-1.44□□□□□ -2.64
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RNU6-38P-201ENST00000384085 I3L2K1 104 aa-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2G1P62253 170 aa-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-38P-201ENST00000384085 MIC13Q5XKP0 118 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC37A3O60309 1634 aa-1.45□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-1.45□□□□□ -2.64
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RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 PLXNB2O15031 1838 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 PKHD1P08F94 4074 aa-1.46□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 SYNJ1O43426 1573 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAT1Q14517 4588 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSTD3H0UI37 97 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 M0R129 80 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 FABP1P07148 127 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 SAR1AQ9NR31 198 aa-1.47□□□□□ -2.64
RNU6-38P-201ENST00000384085 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-1.47□□□□□ -2.65
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