RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3-11P01762 117 aa10.59□□□□□ -0.71
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CTIF-202ENST00000382998 LINC01356Q8N9X3 169 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-202ENST00000382998 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-202ENST00000382998 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CTIF-202ENST00000382998 Q6P435 159 aa10.59□□□□□ -0.71
CTIF-202ENST00000382998 MDFIQ99750 246 aa10.59□□□□□ -0.71
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CTIF-202ENST00000382998 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa10.55□□□□□ -0.72
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CTIF-202ENST00000382998 WDR86Q86TI4 376 aa10.55□□□□□ -0.72
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CTIF-202ENST00000382998 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa10.53□□□□□ -0.72
CTIF-202ENST00000382998 TNCP24821 2201 aa10.53□□□□□ -0.72
CTIF-202ENST00000382998 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa10.53□□□□□ -0.72
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CTIF-202ENST00000382998 IGLV1-44P01699 117 aa10.52□□□□□ -0.73
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CTIF-202ENST00000382998 Q6JHZ5 121 aa10.52□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 NKAPP1Q8N9T2 125 aa10.52□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa10.52□□□□□ -0.73
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CTIF-202ENST00000382998 EML6Q6ZMW3 1958 aa10.51□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.51□□□□□ -0.73
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CTIF-202ENST00000382998 C10orf142B7Z368 130 aa10.51□□□□□ -0.73
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CTIF-202ENST00000382998 TMEM141Q96I45 108 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 C15orf65H3BRN8 121 aa10.5□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 A0A087WZ39 114 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 COX7A2LO14548 114 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 ODF3L1Q8IXM7 274 aa10.49□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
CTIF-202ENST00000382998 CCKP06307 115 aa10.49□□□□□ -0.73
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