RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 NAT8BQ9UHF3 227 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa10.52□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH10OSP0CZ25 163 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 RIGQ13278 110 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 WFDC10BQ8IUB3 73 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf223Q8N319 242 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.51□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 KMT2AQ03164 3969 aa10.51□□□□□ -0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 RASL11AQ6T310 242 aa10.5□□□□□ -0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa10.49□□□□□ -0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.49□□□□□ -0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 S100A8P05109 93 aa10.46□□□□□ -0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.46□□□□□ -0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 LINC00862A6NCI5 91 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 PKIAP61925 76 aa10.45□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 GATD1Q8NB37 220 aa10.44□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 A0A087WX48 190 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-30P01768 117 aa10.43□□□□□ -0.74
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PGGT1B-202ENST00000379615 CHCHD7Q9BUK0 85 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 SEC11CQ9BY50 192 aa10.43□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.42□□□□□ -0.74
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PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R17O96001 155 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 ELOBQ15370 118 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 NIT1Q86X76 327 aa10.42□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10.41□□□□□ -0.74
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PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM262E9PQX1 116 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB4AP20338 218 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 CAMPP49913 170 aa10.41□□□□□ -0.74
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PGGT1B-202ENST00000379615 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.41□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAH10Q8IVF4 4471 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 HERC2O95714 4834 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 COTL1Q14019 142 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 AMN1Q8IY45 258 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 CTDSP1Q9GZU7 261 aa10.4□□□□□ -0.74
PGGT1B-202ENST00000379615 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCYAP1P18509 176 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 IQCJQ1A5X6 159 aa10.39□□□□□ -0.75
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PGGT1B-202ENST00000379615 FAM104BQ5XKR9 115 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 RNF185Q96GF1 192 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 ST20Q9HBF5 79 aa10.39□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 TNP2Q05952 138 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.38□□□□□ -0.75
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PGGT1B-202ENST00000379615 A0A1B0GXF2 115 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 SDHAF1A6NFY7 115 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 NCR2O95944 276 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PMCHP20382 165 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 AMTP48728 403 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 BTF3L4Q96K17 158 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 TM2D2Q9BX73 214 aa10.37□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 EREGO14944 169 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PSCAO43653 123 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 CKS2P33552 79 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 RMI2Q96E14 147 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 Q9HAA7 133 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 COX11Q9Y6N1 276 aa10.36□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 I3L3M4 83 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE2L6O14933 153 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 PPBPP02775 128 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 Q0VG73 95 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 NDUFA5Q16718 116 aa10.35□□□□□ -0.75
PGGT1B-202ENST00000379615 C10orf91Q5T1B1 145 aa10.35□□□□□ -0.75
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