RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 TRACP01848 142 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRK-207ENST00000368226 Q6YL49 198 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRK-207ENST00000368226 Q6ZPA2 131 aa9.8□□□□□ -0.84
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PTPRK-207ENST00000368226 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.853e-6■■■■□ 20.3
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PTPRK-207ENST00000368226 C11orf71Q6IPW1 123 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRK-207ENST00000368226 Q6ZS46 218 aa9.71□□□□□ -0.86
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PTPRK-207ENST00000368226 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa9.67□□□□□ -0.86
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PTPRK-207ENST00000368226 CEP192Q8TEP8 1941 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-207ENST00000368226 MED12LQ86YW9 2145 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-207ENST00000368226 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa9.67□□□□□ -0.86
PTPRK-207ENST00000368226 E9PLD3 99 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-207ENST00000368226 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRK-207ENST00000368226 ACACBO00763 2458 aa9.66□□□□□ -0.86
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