RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 INAFM1C9JVW0 142 aa17■□□□□ 0.31
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PTPRM-201ENST00000332175 IGHV4-31P0DP07 118 aa17■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 NFE4Q86UQ8 179 aa17■□□□□ 0.31
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1B0GX51 115 aa17■□□□□ 0.31
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PTPRM-201ENST00000332175 INSL3P51460 131 aa16.99■□□□□ 0.31
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PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.98■□□□□ 0.31
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PTPRM-201ENST00000332175 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM131Q92545 1883 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRM-201ENST00000332175 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa16.87■□□□□ 0.29
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PTPRM-201ENST00000332175 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00467Q9BRT7 94 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 PCNX2A6NKB5 2137 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 HILS1P60008 231 aa16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 SHANK1Q9Y566 2161 aa16.84■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 C14orf177Q52M58 125 aa16.83■□□□□ 0.29
PTPRM-201ENST00000332175 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 MED13LQ71F56 2210 aa16.83■□□□□ 0.28
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PTPRM-201ENST00000332175 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 ATOX1O00244 68 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WZ39 114 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 TAX1BP3O14907 124 aa16.82■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV4-1P06312 121 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 PTH2Q96A98 100 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 CRYGBP07316 175 aa16.81■□□□□ 0.28
PTPRM-201ENST00000332175 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.8■□□□□ 0.28
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