RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 ODF3Q96PU9 254 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 MUC4Q99102 2169 aa8.43□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 LY6HO94772 140 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 RAX2Q96IS3 184 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 J3KRW8 73 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 BRI3O95415 125 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TGFAP01135 160 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 MDFICQ9P1T7 246 aa8.42□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 CRLF1O75462 422 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TTC32Q5I0X7 151 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ARL3P36405 182 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 DEFB121Q5J5C9 76 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 PRORYQ9H606 182 aa8.41□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 H3BT86 120 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 ELANEP08246 267 aa8.4□□□□□ -1.06
GINS3-202ENST00000328514 CSMD1Q96PZ7 3565 aa8.4□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 TRAV41A0A0B4J266 112 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 LITAFQ99732 161 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 FAM110AQ9BQ89 295 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 A0A0J9YXY3 114 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 H3BMM0 161 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 M0QY20 66 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 SAA4P35542 130 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 FAM159AQ6UWV7 190 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 C20orf203Q8NBC4 194 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 UBE2WQ96B02 151 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 C9orf85Q96MD7 179 aa8.39□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 RELNP78509 3460 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 CCDC179H3BU77 68 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 TRIAP1O43715 76 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 JPT2Q9H910 190 aa8.38□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 LRBAP50851 2863 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 F6UB75 175 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 H3BUA1 57 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 DEFB1P60022 68 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 SPANXCQ9NY87 97 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 ATMQ13315 3056 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WWL8 130 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 F5H697 171 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 H7C423 109 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 Q1RN00 199 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 USMG5Q96IX5 58 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 MOB4Q9Y3A3 225 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa8.37□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.36□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 H7C2G1 150 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 TRBV12-3P01733 135 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 IGHV4-39P01824 125 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 C2orf82Q6UX34 121 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 EDA2RQ9HAV5 297 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 NOTCH2Q04721 2471 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 A0A0J9YXV3 536 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 I3L3M4 83 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 NPFFO15130 113 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 COX6CP09669 75 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 C2CD3Q4AC94 2353 aa8.35□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 COL6A6A6NMZ7 2263 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 FBN2P35556 2912 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 LST1O00453 97 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 ITPR3Q14573 2671 aa8.34□□□□□ -1.07
GINS3-202ENST00000328514 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TIMM21Q9BVV7 248 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 K7EMT4 169 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 TIMM17BO60830 172 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 ID1P41134 155 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 MIAQ16674 131 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 FAM104AQ969W3 186 aa8.33□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 CREBBPQ92793 2442 aa8.32□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GINS3-202ENST00000328514 LY6DQ14210 128 aa8.32□□□□□ -1.08
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