RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300213.8

CCNDBP1-201, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNDBP1, Length 3,660 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 LGALS9O00182 355 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 LINC00694P0DN24 101 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 ICOSQ9Y6W8 199 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 COX8CQ7Z4L0 72 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.1□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 LY6EQ16553 131 aa11.09□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.09□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 KNCNA6PVL3 124 aa11.08□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 PF4V1P10720 104 aa11.08□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 ATP5J2P56134 94 aa11.08□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.08□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.08□□□□□ -0.63
CCNDBP1-201ENST00000300213 H7C423 109 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF883P0CG24 379 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 EPG5Q9HCE0 2579 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCDC140Q96MF4 163 aa11.08□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 LY6LH3BQJ8 138 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV12-3P01733 135 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRI3O95415 125 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 GRNP28799 593 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 NPBQ8NG41 125 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM141Q96I45 108 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 VPREB3Q9UKI3 123 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0J9YXY3 114 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGIPA6NJ69 53 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa11.07□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 GPHB5Q86YW7 130 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 LEPROTO15243 131 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 C9orf139Q6ZV77 190 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 MYO9AB2RTY4 2548 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.06□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 SONP18583 2426 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q8N9W7 124 aa11.05□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZNF292O60281 2723 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 P0DMU3 169 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM231AP0DMU4 169 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM231CP0DMU5 169 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 MDFICQ9P1T7 246 aa11.04□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 I3L3M4 83 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 MUC4Q99102 2169 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 OVOL1O14753 267 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 A0A0B4J2C4 111 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGFL2Q6UWQ7 119 aa11.03□□□□□ -0.64
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLQO75417 2590 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM223A0PJW6 202 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 M0R1W7 72 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 SAA4P35542 130 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 HERVK_113P63121 156 aa11.02□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 TIMM17AQ99595 171 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 ABCA2Q9BZC7 2435 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 RHOHQ15669 191 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 SPINK13Q1W4C9 94 aa11.01□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 NPFFO15130 113 aa11□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 BRD3OSQ6XYD6 125 aa11□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 RNF223E7ERA6 249 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 NXPH4O95158 308 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 SYNJ2BPP57105 145 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 TMEM126AQ9H061 195 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 LRRK2Q5S007 2527 aa10.99□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFHX3Q15911 3703 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q9HAA7 133 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 hADV29S1A0JD25 119 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 PRM2P04554 102 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 EDN2P20800 178 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 PROK1P58294 105 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 Q6Q795 121 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 AMELXQ99217 191 aa10.98□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 CCL21O00585 134 aa10.97□□□□□ -0.65
CCNDBP1-201ENST00000300213 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms