RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292729.12

USP41-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 41, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene USP41, Length 920 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP41-201ENST00000292729 A8MWV9 139 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 USP17L23D6RBM5 183 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 M0R036 132 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SMIM12Q96EX1 92 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 RNF185Q96GF1 192 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.64□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 C7orf77A4D0Y5 90 aa6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 PANO1I0J062 215 aa6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 CRPP02741 224 aa6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 PRSS1P07477 247 aa6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 UBE2G2P60604 165 aa6.63□□□□□ -1.35
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USP41-201ENST00000292729 LINC00479Q96M42 142 aa6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.63□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 A0A0J9YXV3 536 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 CEBPGP53567 150 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 ANAPC16Q96DE5 110 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 OTORQ9NRC9 128 aa6.62□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 PPP1R2P9O14990 202 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 SCO1O75880 301 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 HLA-DQA1P01909 254 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 MT-ND4LP03901 98 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 ENHOQ6UWT2 76 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 C7orf33Q8WU49 177 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 DPH3Q96FX2 82 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 BTF3L4Q96K17 158 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.61□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 PEX7O00628 323 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 AKR1C3P42330 323 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 KRTAP10-8P60410 259 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 RPL23P62829 140 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 MIAQ16674 131 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 ZNF674Q2M3X9 581 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 WDR73Q6P4I2 378 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 BIN3Q9NQY0 253 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 Q9UF83 564 aa6.6□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 A0A087WYN8 130 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 TMEM262E9PQX1 116 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 K7EQM0 130 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 RHODO00212 210 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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USP41-201ENST00000292729 ODF1Q14990 250 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 ADIRFQ15847 76 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 LINC01551Q86U37 167 aa6.59□□□□□ -1.35
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USP41-201ENST00000292729 FMC1Q96HJ9 113 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 IMMP2LQ96T52 175 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 C11orf21Q9P2W6 132 aa6.59□□□□□ -1.35
USP41-201ENST00000292729 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 PHOX2AO14813 284 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 GNG4P50150 75 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 PKIAP61925 76 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 REG3GQ6UW15 175 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 ISOC2Q96AB3 205 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 EPDR1Q9UM22 224 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.58□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.57□□□□□ -1.36
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USP41-201ENST00000292729 A0A0U1RQV1 116 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 GCGP01275 180 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TCRAP04437 139 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 S100PP25815 95 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 UBE2G1P62253 170 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 CENPWQ5EE01 88 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 DERL1Q9BUN8 251 aa6.57□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.56□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SMUG1Q53HV7 270 aa6.56□□□□□ -1.36
USP41-201ENST00000292729 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.56□□□□□ -1.36
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