RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 A4D1N5 150 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SLURP1P55000 103 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 H3BMM0 161 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 UBE2WQ96B02 151 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 ABCA4P78363 2273 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.59□□□□□ -1.35
HERC3-201ENST00000264345 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 A0A1W2PRX2 142 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 CFHR3Q02985 330 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 HERV-K104P63124 156 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZQT7 251 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TSHBP01222 138 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 Q96MF0 132 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 XCL2Q9UBD3 114 aa6.58□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-30P01768 117 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 CRYGDP07320 174 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 P0DMU3 169 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 FAM231AP0DMU4 169 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 FAM231CP0DMU5 169 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TTC28Q96AY4 2481 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 PTH2Q96A98 100 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TMEM243Q9BU79 118 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.57□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 K7EQD1 137 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 SPATA25Q9BR10 227 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ZNF702PQ9H963 129 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 A0A0J9YXY3 114 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 CRPP02741 224 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 PF4P02776 101 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TCL1BO95988 128 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 UBE2D1P51668 147 aa6.56□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 LINC01620Q4KN68 170 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TIMM17BO60830 172 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 MIAQ16674 131 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RS1O15537 224 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZS46 218 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 C16orf74Q96GX8 76 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.55□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TIRAPP58753 221 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 DEFB136Q30KP8 78 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 GAGE12JA6NER3 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 GAGE4Q13068 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 GAGE5Q13069 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 SPANXCQ9NY87 97 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 H3BT86 120 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-53P01767 116 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.54□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 CCL24O00175 119 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 LINC00158P58513 81 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 LINC00315P59091 139 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 DEFB114Q30KQ6 69 aa6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
HERC3-201ENST00000264345 H7C423 109 aa6.52□□□□□ -1.37
HERC3-201ENST00000264345 ACYP1P07311 99 aa6.52□□□□□ -1.37
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