RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
PDGFRB-201ENST00000261799 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
PDGFRB-201ENST00000261799 COX7BP24311 80 aa10.21□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.21□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 C10orf99Q6UWK7 81 aa10.2□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa10.2□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 HIGD2AQ9BW72 106 aa10.2□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 MSRB1Q9NZV6 116 aa10.2□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 GPR179Q6PRD1 2367 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV2-14P01704 120 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa10.19□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 CFC1BP0CG36 223 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 CFC1P0CG37 223 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 H0Y9J4 135 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 C16orf95Q9H693 158 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 ALPK2Q86TB3 2170 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 CTRLP40313 264 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00474Q9P2X8 69 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa10.18□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 NREPQ16612 68 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 ADCYAP1P18509 176 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 MIAQ16674 131 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 Q8N976 141 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 CITED1Q99966 193 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 FSHBP01225 129 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF747Q9BV97 191 aa10.17□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 CRYGBP07316 175 aa10.16□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 C18orf65Q6ZTR6 163 aa10.16□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 BAALCQ8WXS3 180 aa10.16□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 C20orf173Q96LM9 149 aa10.16□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 RS1O15537 224 aa10.15□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 NPSP0C0P6 89 aa10.15□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 C9orf118A6NHY6 69 aa10.15□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa10.15□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 MUC6Q6W4X9 2439 aa10.15□□□□□ -0.78
PDGFRB-201ENST00000261799 MP68P56378 58 aa10.15□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.15□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 C11orf86A6NJI1 115 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 SYCNQ0VAF6 134 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 MUSTN1Q8IVN3 82 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 C20orf203Q8NBC4 194 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CDSNQ15517 529 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC01620Q4KN68 170 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZUT4 128 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 DOCK7Q96N67 2140 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CACNA1HO95180 2353 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 PCNX2A6NKB5 2137 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLC3P0DOY3 106 aa10.14□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 UBE2D3P61077 147 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 LELP1Q5T871 98 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 ZGRF1Q86YA3 2104 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 ODF1Q14990 250 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV1-40P01703 118 aa10.13□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 HEATR5AQ86XA9 2040 aa10.12□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CACNA1DQ01668 2161 aa10.12□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 NUP210LQ5VU65 1888 aa10.12□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.12□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 DYSFO75923 2080 aa10.12□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.12□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 C12orf74Q32Q52 190 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 Q8N6K4 173 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 F8W1H4 67 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 DAND5Q8N907 189 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CLUHP3Q96NS8 147 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1B0GX51 115 aa10.11□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 WFDC10AQ9H1F0 79 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 ZFAND3Q9H8U3 227 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CEP192Q8TEP8 1941 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 C9orf85Q96MD7 179 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 LECT2O14960 151 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 CRYBA4P53673 196 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 DOCK9Q9BZ29 2069 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 SEC61GP60059 68 aa10.09□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 K7ERJ3 54 aa10.09□□□□□ -0.79
PDGFRB-201ENST00000261799 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 C1orf134Q5TEV5 83 aa10.08□□□□□ -0.8
PDGFRB-201ENST00000261799 GTF3C1Q12789 2109 aa10.08□□□□□ -0.8
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