RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa15.01□□□□□ -0.01
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa15.01□□□□□ -0.01
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SYF2-201ENST00000236273 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.88□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 TMEM262E9PQX1 116 aa14.88□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 CAMPP49913 170 aa14.88□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.88□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.88□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 ANAPC16Q96DE5 110 aa14.88□□□□□ -0.03
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SYF2-201ENST00000236273 A0A087WX48 190 aa14.87□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa14.87□□□□□ -0.03
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SYF2-201ENST00000236273 Q8N976 141 aa14.86□□□□□ -0.03
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SYF2-201ENST00000236273 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.85□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
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SYF2-201ENST00000236273 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.84□□□□□ -0.03
SYF2-201ENST00000236273 NCR2O95944 276 aa14.84□□□□□ -0.03
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