RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WW49 117 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 VCYO14598 125 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 GNRH2O43555 120 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 SRD5A1P18405 259 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 SYNJ2BPP57105 145 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZQT7 251 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 ERASQ7Z444 233 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 PCP2Q8IVA1 136 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM86BQ8N661 226 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM141Q96I45 108 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 CSTL1Q9H114 145 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.87□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf118A6NHY6 69 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 OR11H12B2RN74 326 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 F5H697 171 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 CCL25O15444 150 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB1P60022 68 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 HERVK_113P61574 105 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 GTSCR1Q86UQ5 136 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N2B8 174 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 OR11H1Q8NG94 326 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 OR11H2Q8NH07 326 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf85Q96MD7 179 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 HHLA3Q9XRX5 114 aa6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01619G3V211 115 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 K7EP13 123 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 RHOHQ15669 191 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 DUX5Q96PT3 197 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.85□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM13P0DJ93 91 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 GCSHP23434 173 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 RIPPLY3P57055 190 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TCTAP57738 103 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF56Q15929 161 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZVH6 145 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 BAALCQ8WXS3 180 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMM17AQ99595 171 aa6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WWL8 130 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 GAGE10A6NGK3 116 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 K7EP34 96 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 FABP2P12104 132 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 EDN2P20800 178 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SCGB2A2Q13296 93 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 Q96MF0 132 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.83□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 E9PLD3 99 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00315P59091 139 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PMVKQ15126 192 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 CEND1Q8N111 149 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TM2D2Q9BX73 214 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TACC2O95359 2948 aa6.82□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.82□□□□□ -1.321e-7■■■□□ 18.5
EFTUD2-222ENST00000592408 MED13LQ71F56 2210 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP6Q13023 2319 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1W2PPM0 123 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MTW9 85 aa6.81□□□□□ -1.32
EFTUD2-222ENST00000592408 H3BUT2 72 aa6.81□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.8 ms