RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589585.1

CTIF-207, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 4

Gene CTIF, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-207ENST00000589585 GAGE12JA6NER3 117 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 GZMBP10144 247 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 GAGE1Q13065 139 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 GAGE4Q13068 117 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 GAGE5Q13069 117 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 GAGE13Q4V321 117 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 LYPD6BQ8NI32 183 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TPPP3Q9BW30 176 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.38□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 P01737 135 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 CRYGDP07320 174 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 OR5AL1P0C617 328 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 CEBPGP53567 150 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 SPANXN1Q5VSR9 72 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 BIN3Q9NQY0 253 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 PKD1P98161 4303 aa9.37□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 A0A1B0GVY2 172 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 C19orf71A6NCJ1 209 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 SNAI2O43623 268 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TIRAPP58753 221 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 RPS20P60866 119 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TNP2Q05952 138 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 OR10J3Q5JRS4 329 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TOR2AQ5JU69 321 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 Q9UF83 564 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 PKHD1P08F94 4074 aa9.36□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 XKRY2A2RUG3 117 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 TMEM250H0YL14 139 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 EVI2AP22794 236 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 LINC00315P59091 139 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 OCC1Q8TAD7 63 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 GTSF1LQ9H1H1 148 aa9.35□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 ZNF56Q15929 161 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 LELP1Q5T871 98 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 NUDT11Q96G61 164 aa9.34□□□□□ -0.91
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 F5H697 171 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 K7EN84 100 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 SMIM17P0DL12 118 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa9.33□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 RYR1P21817 5038 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 IGLC6P0CF74 106 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 LINC00694P0DN24 101 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 RAB4BP61018 213 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 FAM210AQ96ND0 272 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 AP1S3Q96PC3 154 aa9.32□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 F2Z2F3 143 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 K7EP13 123 aa9.31□□□□□ -0.92
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CTIF-207ENST00000589585 TEX261Q6UWH6 196 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 MSRB1Q9NZV6 116 aa9.31□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-30P01768 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-33P01772 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 NFE4Q86UQ8 179 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 C10orf126Q8N4M7 172 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 SMIM7Q9BQ49 75 aa9.3□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 A0A087WWC5 75 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 ZNF727A8MUV8 499 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 MGPP08493 103 aa9.29□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 GATCO43716 136 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 NTF3P20783 257 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 ERVFC1-1P60608 527 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa9.28□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.27□□□□□ -0.92
CTIF-207ENST00000589585 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 CTRLP40313 264 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 UBE2D3P61077 147 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 UBE2D2P62837 147 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 OR10G8Q8NGN5 311 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.27□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 TRGC1P0CF51 173 aa9.26□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 TWIST1Q15672 202 aa9.26□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.26□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 LINC01551Q86U37 167 aa9.26□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 Q8N3U1 123 aa9.26□□□□□ -0.93
CTIF-207ENST00000589585 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
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