RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM74A4Q5TZK3 123 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 SPANXN1Q5VSR9 72 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZSN1 163 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF479Q96JC4 524 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 IMMP2LQ96T52 175 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 CTDSP1Q9GZU7 261 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 SCRT2Q9NQ03 307 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 DKK2Q9UBU2 259 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa4.28□□□□□ -1.72
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GUT8 65 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GXF2 115 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 XKRY2A2RUG3 117 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM9A6NGZ8 99 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SMKR1H3BMG3 65 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 M0R2P5 195 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5AL1P0C617 328 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 P0DMU3 169 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM231AP0DMU4 169 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM231CP0DMU5 169 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 MIFP14174 115 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB4BP61018 213 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf74Q32Q52 190 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF876PQ49A33 203 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 GFRA4Q9GZZ7 299 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMAT4Q9H898 229 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 Q9UF83 564 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.27□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 NACAE9PAV3 2078 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TRGV2A0A075B6R0 118 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 CXorf65A6NEN9 183 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 COLCA2A8K830 154 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 NXPH4O95158 308 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 NCR2O95944 276 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 CRYGDP07320 174 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 S100PP25815 95 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 DAD1P61803 113 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RIGQ13278 110 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA1644Q3SXP7 199 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP126Q5VTH2 177 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNIP4Q6PIL6 250 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZTC4 211 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 AMN1Q8IY45 258 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFP82Q8N141 532 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF185Q96GF1 192 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SPXQ9BT56 116 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 U3KQK5 164 aa4.26□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0J9YY99 117 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RS1O15537 224 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SPART-AS1P0CW21 52 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00315P59091 139 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 CACNG7P62955 275 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 HBBP68871 147 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 FHL2Q14192 279 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF56Q15929 161 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00612Q8N6U2 182 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4C5Q8NGB2 326 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 BORCS7Q96B45 105 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 BTF3L4Q96K17 158 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM210BQ96KR6 192 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 CNFNQ9BYD5 112 aa4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM231BA6NCW3 169 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 LYRM9A8MSI8 78 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 F2Z2F3 143 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 F5H697 171 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 F5H768 121 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB4AP20338 218 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS10P46783 165 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SLAQ13239 276 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 SUMO4Q6EEV6 95 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 UFSP1Q6NVU6 142 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 NEGR1Q7Z3B1 354 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 C11orf45Q8TAV5 145 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RASL10AQ92737 203 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 AP1S3Q96PC3 154 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 EDA2RQ9HAV5 297 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM242Q9NWH2 141 aa4.24□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A096LPF7 62 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 GAGE12JA6NER3 117 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 TRGC1P0CF51 173 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB5AP20339 215 aa4.23□□□□□ -1.73
CAPNS1-208ENST00000589162 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms