RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587934.1

GIPC1-208, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene GIPC1, Length 330 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-208ENST00000587934 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 CCL17Q92583 94 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 TOMM6Q96B49 74 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 CITED1Q99966 193 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 C20orf78Q9BR46 151 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 ERG28Q9UKR5 140 aa7.23□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 M0R381 172 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 TIMM23O14925 209 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 TSPAN13O95857 204 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 UBE2D3P61077 147 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 HERVK_113P61574 105 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 UBE2D2P62837 147 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 ERCC8Q13216 396 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 TEN1Q86WV5 123 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 CFHR4Q92496 578 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 RYR2Q92736 4967 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 TENM3Q9P273 2699 aa7.22□□□□□ -1.25
GIPC1-208ENST00000587934 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 F8W735 103 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 GAS8-AS1O95177 125 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 IGHG4P01861 327 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 COX7A1P24310 79 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 INSL3P51460 131 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 DYNAPQ8N1N2 210 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.21□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 AGRNO00468 2067 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ZNF815PA8K554 130 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 A8MWV9 139 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 PPP1R17O96001 155 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 TRGV3P03979 118 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ZNF688P0C7X2 276 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 MED14OSP0DP75 135 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 PSMB2P49721 201 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 KRTAP10-3P60369 221 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 DPM3Q9P2X0 92 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 LENEPQ9Y5L5 61 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.2□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 MT-ATP8P03928 68 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 GATA3P23771 443 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 HLA-DMBP28068 263 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 MRAPQ8TCY5 172 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.19□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 OOSP1A8MZH6 123 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ASIPP42127 132 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 XGP55808 180 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 KLK9Q2XQG4 91 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 BAALCQ8WXS3 180 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 CARD19Q96LW7 228 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 KLK9Q9UKQ9 250 aa7.18□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 CLEC3BP05452 202 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 CD7P09564 240 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 PPIFP30405 207 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 GAGE5Q13069 117 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 GAGE6Q13070 117 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 Q6Q795 121 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 NFE4Q86UQ8 179 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 RNF183Q96D59 192 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.17□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 CLPSL1A2RUU4 121 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ODF3BA8MYP8 253 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 PRAC2D3DTV9 90 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 M0R1W7 72 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 CTSGP08311 255 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 LINC01600Q96MT4 127 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.16□□□□□ -1.26
GIPC1-208ENST00000587934 ZFAND3Q9H8U3 227 aa7.16□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms