RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 TCF15Q12870 199 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF56Q15929 161 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-202ENST00000586851 AMELXQ99217 191 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-202ENST00000586851 TIMM21Q9BVV7 248 aa5.78□□□□□ -1.48
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 A4D1N5 150 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 DSCR9P59020 149 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE2BQ13066 116 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE5Q13069 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE6Q13070 117 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01620Q4KN68 170 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE2EQ4V326 116 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 DCANP1Q8TF63 244 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CLUHP3Q96NS8 147 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 PRORYQ9H606 182 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 USP34Q70CQ2 3546 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA1HO95180 2353 aa5.77□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 BDP1A6H8Y1 2624 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 C9JAW5 83 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BMM0 161 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GNRH2O43555 120 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 LY6HO94772 140 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CFHR3Q02985 330 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 MIAQ16674 131 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 Q1RN00 199 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2WQ96B02 151 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CARD19Q96LW7 228 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CITED1Q99966 193 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IMUPQ9GZP8 106 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CFAP54Q96N23 3096 aa5.76□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ROS1P08922 2347 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 COL6A3P12111 3177 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MTW9 85 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 K7EQG2 157 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP5G1P05496 136 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 XGP55808 180 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB121Q5J5C9 76 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 OVOL2Q9BRP0 275 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 SPXQ9BT56 116 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.75□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 J3QLI3 93 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ELANEP08246 267 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 INSL3P51460 131 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TIRAPP58753 221 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF415Q09FC8 603 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXC1Q12948 553 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TTC32Q5I0X7 151 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.74□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 SPEGQ15772 3267 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01548A6NM66 108 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BUX3 64 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 J3KRW8 73 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 MT-ATP8P03928 68 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CD28P10747 220 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMB8P28062 276 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 TSPEAR-AS2P59090 65 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL39P62891 51 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 SELENOKQ9Y6D0 94 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 APC2O95996 2303 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA1BQ00975 2339 aa5.73□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 MUC3AQ02505 3323 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WWL8 130 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE12JA6NER3 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 B4DSR2 109 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE7O76087 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 PF4P02776 101 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 MSMBP08118 114 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE12FP0CL80 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE12GP0CL81 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 GAGE12IP0CL82 117 aa5.72□□□□□ -1.49
CAPNS1-202ENST00000586851 HERV-K104P63124 156 aa5.72□□□□□ -1.49
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