RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 LGALS9O00182 355 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-23P01764 117 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 CSN3P07498 182 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ELANEP08246 267 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 S100A4P26447 101 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 HSD52Q0P140 79 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 LAGE3Q14657 143 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ZNF124Q15973 351 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 BATFQ16520 125 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 Q8TAT8 98 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 HIGD1BQ9P298 99 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 S4R3C0 116 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.06□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TMEM213A2RRL7 107 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 J3QL48 77 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 SOCS3O14543 225 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 NXPH4O95158 308 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 SMIM17P0DL12 118 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PF4V1P10720 104 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 CFHR3Q02985 330 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ERASQ7Z444 233 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 RNF152Q8N8N0 203 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 SYT8Q8NBV8 401 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.05□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 DPM2O94777 84 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 NPYP01303 97 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 EVI2AP22794 236 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 UBE2V1Q13404 147 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TAL2Q16559 108 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TM4SF20Q53R12 229 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 Q6YL49 198 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ATOH7Q8N100 152 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TMEM86BQ8N661 226 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 RNF185Q96GF1 192 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.04□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 A0A1B0GVY2 172 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 KLLNB2CW77 178 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 LINC01619G3V211 115 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGKCP01834 107 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 PSMB8P28062 276 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 TMEM219Q86XT9 240 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 RNF182Q8N6D2 247 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 ZMAT4Q9H898 229 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.03□□□□□ -1.44
GGA3-218ENST00000584243 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WW49 117 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 A0A096LNJ9 63 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 NUDT3O95989 172 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 PRSS1P07477 247 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 NPSP0C0P6 89 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 PTTG1IPP53801 180 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 ERCC8Q13216 396 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 STPG4Q8N801 248 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.02□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 hDV102S1A0JD36 115 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 PRAC2D3DTV9 90 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 H7C1H1 209 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 ODF1Q14990 250 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 NRACQ8N912 160 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 TMEM141Q96I45 108 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 KIR2DL4Q99706 377 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 PEMTQ9UBM1 199 aa6.01□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WX48 190 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 F8VRH5 84 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 H0Y8G0 127 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 H3BRM9 83 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 H3BVH4 76 aa6□□□□□ -1.45
GGA3-218ENST00000584243 LY6G6CO95867 125 aa6□□□□□ -1.45
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