RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 AP1S3Q96PC3 154 aa8.14□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 RHODO00212 210 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 RASL11AQ6T310 242 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZTC4 211 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 GATD1Q8NB37 220 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 ZNF479Q96JC4 524 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 JPT2Q9H910 190 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.13□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 S100A8P05109 93 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 EVI2AP22794 236 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 LINC00315P59091 139 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 SSTP61278 116 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 FHL2Q14192 279 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 YPEL4Q96NS1 127 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.12□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 HBBP68871 147 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 SLAQ13239 276 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 ELOBQ15370 118 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.11□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 A0A087WWL8 130 aa8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 SMIM17P0DL12 118 aa8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 HOXA5P20719 270 aa8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 FRZBQ92765 325 aa8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-53P01767 116 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 CAMPP49913 170 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 RAB4BP61018 213 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 COX19Q49B96 90 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 FAM210BQ96KR6 192 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 PRO0255Q9UI72 69 aa8.09□□□□□ -1.11
GGA3-211ENST00000582232 F5H768 121 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 H3BNG1 76 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 CRYBA4P53673 196 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZSN1 163 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.08□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.07□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 RAB4AP20338 218 aa8.07□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.07□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 RNF185Q96GF1 192 aa8.07□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.07□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 MGPP08493 103 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 HTN3P15516 51 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 RHOHQ15669 191 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 ZNF56Q15929 161 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 AMN1Q8IY45 258 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 SLC25A29Q8N8R3 303 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 MUC7Q8TAX7 377 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 VSIG2Q96IQ7 327 aa8.06□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 NUPR2A6NF83 97 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 F5H697 171 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 H7C1H1 209 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 K7EQD1 137 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 M0QY20 66 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 PAX4O43316 350 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 SCO1O75880 301 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 HLA-DQA1P01909 254 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 MT-ND6P03923 174 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 SUMO4Q6EEV6 95 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 MRAP2Q96G30 205 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.05□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 COLCA2A8K830 154 aa8.04□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 PPBPP02775 128 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 LINC00694P0DN24 101 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 TCTAP57738 103 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 NIT2Q9NQR4 276 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.03□□□□□ -1.12
GGA3-211ENST00000582232 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 A0A0J9YY99 117 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 C3orf84H3BNL1 204 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 PPP1R17O96001 155 aa8.02□□□□□ -1.13
GGA3-211ENST00000582232 GYPEP15421 78 aa8.02□□□□□ -1.13
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