RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 C16orf90A8MZG2 172 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 CDK2AP2O75956 126 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 ORM1P02763 201 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 AMTNQ6UX39 209 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 GTSF1Q8WW33 167 aa9.6□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0J9YX75 114 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 F2Z2F3 143 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 OR8A1Q8NGG7 326 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 C12orf57Q99622 126 aa9.59□□□□□ -0.87
SPNS3-202ENST00000572078 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 A8MTW9 85 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 GZMBP10144 247 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 FABP4P15090 132 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 DAD1P61803 113 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01559Q495D7 138 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 PDZD11Q5EBL8 140 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 OR10D4PQ8NGN7 298 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ZNRF2Q8NHG8 242 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa9.58□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 PLAC8L1A1L4L8 177 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SRIP30626 198 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 RRN3P1Q2M238 152 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 GFI1BQ5VTD9 330 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 GATD1Q8NB37 220 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 TPPP3Q9BW30 176 aa9.57□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV21A0A0B4J279 112 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ESDP10768 282 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 KIAA1644Q3SXP7 199 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 EBLN2Q6P2I7 272 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 LYZL1Q6UWQ5 148 aa9.56□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 GRIFINA4D1Z8 144 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 GPX1P07203 203 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ARMS2P0C7Q2 107 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 CTRLP40313 264 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 LEPP41159 167 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SLAQ13239 276 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 DNLZQ5SXM8 178 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 DMRTA1Q5VZB9 504 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 C6orf223Q8N319 242 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.55□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 IFITM10A6NMD0 228 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 M0R2Z0 102 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 IGLC6P0CF74 106 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 AZU1P20160 251 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 TSPOP30536 169 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 CACNG7P62955 275 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 Q8N1X5 172 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 C15orf53Q8NAA6 179 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ODF3Q96PU9 254 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.54□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 SERF1AO75920 110 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 DEFB130BP0DP73 79 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 DEFB130AP0DP74 79 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 TWIST1Q15672 202 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM256Q8N2U0 113 aa9.53□□□□□ -0.88
SPNS3-202ENST00000572078 NUDT3O95989 172 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 KCNS1Q96KK3 526 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 FAM19A4Q96LR4 140 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM208Q9BTX3 173 aa9.52□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 LYRM9A8MSI8 78 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 F5H768 121 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP10-2P60368 255 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 CNFNQ9BYD5 112 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 NIT2Q9NQR4 276 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 FAT1Q14517 4588 aa9.51□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 HSBP1O75506 76 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 INSP01308 110 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 OR5AL1P0C617 328 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 RAB4AP20338 218 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 PMCHP20382 165 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 ASIPP42127 132 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 S100A12P80511 92 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 FAM104BQ5XKR9 115 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 SCRT2Q9NQ03 307 aa9.5□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.49□□□□□ -0.89
SPNS3-202ENST00000572078 PPBPP02775 128 aa9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms